RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

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Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 POGKQ9P215 609 aa28.8■■■□□ 2.2
HOXD12-201ENST00000404162 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
HOXD12-201ENST00000404162 DLC1Q96QB1 1528 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXD12-201ENST00000404162 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXD12-201ENST00000404162 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
HOXD12-201ENST00000404162 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRB2O60241 1585 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXD12-201ENST00000404162 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXD12-201ENST00000404162 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM37O94972 964 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXD12-201ENST00000404162 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.7■■■□□ 2.19
HOXD12-201ENST00000404162 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
HOXD12-201ENST00000404162 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
HOXD12-201ENST00000404162 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXD12-201ENST00000404162 APBA3O96018 575 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD12-201ENST00000404162 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD12-201ENST00000404162 CHRNA2Q15822 529 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXD12-201ENST00000404162 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
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HOXD12-201ENST00000404162 STRN4Q9NRL3 753 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRB1O14514 1584 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0232Q92628 1395 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD12-201ENST00000404162 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
HOXD12-201ENST00000404162 YY1P25490 414 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD12-201ENST00000404162 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
HOXD12-201ENST00000404162 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD12-201ENST00000404162 RREB1Q92766 1687 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD12-201ENST00000404162 USP35Q9P2H5 1018 aa28.61■■■□□ 2.17
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HOXD12-201ENST00000404162 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD12-201ENST00000404162 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
HOXD12-201ENST00000404162 PDE3BQ13370 1112 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD12-201ENST00000404162 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD12-201ENST00000404162 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD12-201ENST00000404162 NBPF14Q5TI25 921 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD12-201ENST00000404162 EVA1CP58658 441 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD12-201ENST00000404162 BARGINQ6ZT62 677 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD12-201ENST00000404162 SSH2Q76I76 1423 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXD12-201ENST00000404162 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
HOXD12-201ENST00000404162 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXD12-201ENST00000404162 ATP7BP35670 1465 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXD12-201ENST00000404162 ITSN1Q15811 1721 aa28.5■■■□□ 2.15
HOXD12-201ENST00000404162 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
HOXD12-201ENST00000404162 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXD12-201ENST00000404162 SPON1Q9HCB6 807 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
HOXD12-201ENST00000404162 KCNQ2O43526 872 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXD12-201ENST00000404162 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXD12-201ENST00000404162 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXD12-201ENST00000404162 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
HOXD12-201ENST00000404162 CDK19Q9BWU1 502 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXD12-201ENST00000404162 ACEP12821 1306 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXD12-201ENST00000404162 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXD12-201ENST00000404162 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
HOXD12-201ENST00000404162 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXD12-201ENST00000404162 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXD12-201ENST00000404162 ABTB2Q8N961 1025 aa28.4■■■□□ 2.14
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HOXD12-201ENST00000404162 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
HOXD12-201ENST00000404162 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD12-201ENST00000404162 USP19O94966 1318 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD12-201ENST00000404162 PEAK1Q9H792 1746 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD12-201ENST00000404162 GCP02774 474 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD12-201ENST00000404162 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
HOXD12-201ENST00000404162 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
HOXD12-201ENST00000404162 PLSCR1O15162 318 aa28.32■■■□□ 2.12
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HOXD12-201ENST00000404162 STAC3Q96MF2 364 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 SBF2Q86WG5 1849 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 CASZ1Q86V15 1759 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 NLRP13Q86W25 1043 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 CRB1P82279 1406 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC37A3O60309 1634 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD12-201ENST00000404162 PROM2Q8N271 834 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB7AO95365 584 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD12-201ENST00000404162 DDB1Q16531 1140 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD12-201ENST00000404162 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
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HOXD12-201ENST00000404162 PTGER2P43116 358 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD12-201ENST00000404162 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
HOXD12-201ENST00000404162 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
HOXD12-201ENST00000404162 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXD12-201ENST00000404162 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
HOXD12-201ENST00000404162 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXD12-201ENST00000404162 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
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