RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400299.6

SELENOM-201, Transcript of selenoprotein M, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SELENOM, Length 694 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOM-201ENST00000400299 ZBTB7AO95365 584 aa23.84■■□□□ 1.41
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SELENOM-201ENST00000400299 SYT17Q9BSW7 474 aa23.84■■□□□ 1.41
SELENOM-201ENST00000400299 ROCK1Q13464 1354 aa23.83■■□□□ 1.41
SELENOM-201ENST00000400299 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
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SELENOM-201ENST00000400299 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
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SELENOM-201ENST00000400299 USP35Q9P2H5 1018 aa23.79■■□□□ 1.4
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SELENOM-201ENST00000400299 ALS2Q96Q42 1657 aa23.73■■□□□ 1.39
SELENOM-201ENST00000400299 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.73■■□□□ 1.39
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SELENOM-201ENST00000400299 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.66■■□□□ 1.38
SELENOM-201ENST00000400299 DLC1Q96QB1 1528 aa23.65■■□□□ 1.38
SELENOM-201ENST00000400299 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.65■■□□□ 1.38
SELENOM-201ENST00000400299 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
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SELENOM-201ENST00000400299 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.64■■□□□ 1.37
SELENOM-201ENST00000400299 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.63■■□□□ 1.37
SELENOM-201ENST00000400299 SBF2Q86WG5 1849 aa23.63■■□□□ 1.37
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SELENOM-201ENST00000400299 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.62■■□□□ 1.37
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SELENOM-201ENST00000400299 MTFR1LQ9H019 292 aa23.59■■□□□ 1.37
SELENOM-201ENST00000400299 PEAK1Q9H792 1746 aa23.57■■□□□ 1.36
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SELENOM-201ENST00000400299 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.53■■□□□ 1.36
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SELENOM-201ENST00000400299 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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SELENOM-201ENST00000400299 TXNRD1Q16881 649 aa23.5■■□□□ 1.35
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SELENOM-201ENST00000400299 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.42■■□□□ 1.34
SELENOM-201ENST00000400299 ATP10DQ9P241 1426 aa23.42■■□□□ 1.34
SELENOM-201ENST00000400299 DDB1Q16531 1140 aa23.41■■□□□ 1.34
SELENOM-201ENST00000400299 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SELENOM-201ENST00000400299 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.41■■□□□ 1.34
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SELENOM-201ENST00000400299 LRRC37A3O60309 1634 aa23.4■■□□□ 1.34
SELENOM-201ENST00000400299 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.39■■□□□ 1.33
SELENOM-201ENST00000400299 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SELENOM-201ENST00000400299 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SELENOM-201ENST00000400299 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.332e-9■■■■□ 22
SELENOM-201ENST00000400299 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.37■■□□□ 1.33
SELENOM-201ENST00000400299 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SELENOM-201ENST00000400299 CRB1P82279 1406 aa23.34■■□□□ 1.33
SELENOM-201ENST00000400299 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SELENOM-201ENST00000400299 CPDO75976 1380 aa23.34■■□□□ 1.33
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