RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.17■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.17■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 HFM1A2PYH4 1435 aa22.17■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 EPS15P42566 896 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 PRAM1Q96QH2 718 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 KINO60870 393 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 PRDM2Q13029 1718 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 AK7Q96M32 723 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 ODF2Q5BJF6 829 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 RNF214Q8ND24 703 aa22.16■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 MTMR7Q9Y216 660 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 PDILTQ8N807 584 aa22.15■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
USP25-204ENST00000400183 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.14■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 TRAK2O60296 914 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 FAM177BA6PVY3 158 aa22.13■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 TRIM5Q9C035 493 aa22.12■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 SLC4A2P04920 1241 aa22.12■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.12■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 ATP2B1P20020 1258 aa22.12■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 KLHL34Q8N239 644 aa22.12■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.11■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.11■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.11■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.11■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 SYNJ2O15056 1496 aa22.11■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.1■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.1■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 TXLNAP40222 546 aa22.1■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 KDM4AO75164 1064 aa22.09■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.09■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.08■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
USP25-204ENST00000400183 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 STK38Q15208 465 aa22.08■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.08■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.07■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 FIBPO43427 364 aa22.07■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 TSPY26PQ9H489 355 aa22.07■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 CAGE1Q8TC20 777 aa22.07■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.06■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 WDR63Q8IWG1 891 aa22.06■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 JMYQ8N9B5 988 aa22.06■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.06■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 CDK19Q9BWU1 502 aa22.06■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.06■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.06■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 GRIN2BQ13224 1484 aa22.06■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 SMC2O95347 1197 aa22.06■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 CABP1Q9NZU7 370 aa22.06■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.05■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 BCAR3O75815 825 aa22.05■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 STRN4Q9NRL3 753 aa22.05■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 SMARCE1Q969G3 411 aa22.05■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 ANKRD1Q15327 319 aa22.04■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.04■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.04■■□□□ 1.12
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USP25-204ENST00000400183 CFTRP13569 1480 aa22.03■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.03■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.03■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 MAP7D2Q96T17 732 aa22.03■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.03■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 CABP4P57796 275 aa22.03■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 CCP110O43303 1012 aa22.03■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.02■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.02■■□□□ 1.12
USP25-204ENST00000400183 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.01■■□□□ 1.11
USP25-204ENST00000400183 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.01■■□□□ 1.11
USP25-204ENST00000400183 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.01■■□□□ 1.11
USP25-204ENST00000400183 MYO6Q9UM54 1294 aa22■■□□□ 1.11
USP25-204ENST00000400183 SPG7Q9UQ90 795 aa22■■□□□ 1.11
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