RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.34■■□□□ 1.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGS12O14924 1447 aa23.33■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 SSH2Q76I76 1423 aa23.32■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.31■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 RXRBP28702 533 aa23.31■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.31■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP21Q9UK80 565 aa23.31■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 GLI3P10071 1580 aa23.31■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 EVC2Q86UK5 1308 aa23.3■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.29■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP6P35125 1406 aa23.28■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIK3C2AO00443 1686 aa23.28■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 CABP1Q9NZU7 370 aa23.26■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.25■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.25■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.24■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 TESK2Q96S53 571 aa23.24■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP19O94966 1318 aa23.24■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM83GA6ND36 823 aa23.23■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.23■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.23■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP54Q70EL1 1684 aa23.22■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLIT3O75094 1523 aa23.22■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.22■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.2■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLEKHG5O94827 1062 aa23.17■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 CPDO75976 1380 aa23.16■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.16■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 VPS72Q15906 364 aa23.16■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIAA0232Q92628 1395 aa23.15■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP47Q96K76 1375 aa23.15■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL18A1P39060 1754 aa23.15■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 EP400Q96L91 3159 aa23.15■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.15■■□□□ 1.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABTB2Q8N961 1025 aa23.14■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.13■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.12■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.12■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 BTG4Q9NY30 223 aa23.11■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 NFAT5O94916 1531 aa23.1■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 NLRP13Q86W25 1043 aa23.09■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.09■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.08■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYOM1P52179 1685 aa23.08■■□□□ 1.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 A0A1W2PP64 1363 aa23.07■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 GCP02774 474 aa23.07■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.07■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP31Q70CQ4 1352 aa23.06■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.06■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHRNA2Q15822 529 aa23.06■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.06■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.06■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGPD5Q99666 1765 aa23.05■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 NLRP6P59044 892 aa23.04■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC24A1O60721 1099 aa23.02■■□□□ 1.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.01■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCC6O95255 1503 aa23.01■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 OVOS2Q6IE36 1432 aa23■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 LTN1O94822 1766 aa23■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.99■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.99■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.98■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMC1Q8TDI8 760 aa22.98■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.97■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 NME9Q86XW9 330 aa22.97■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.97■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMF1P82094 1093 aa22.96■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.96■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.93■■□□□ 1.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.93■■□□□ 1.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.92■■□□□ 1.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 STRN4Q9NRL3 753 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.6 ms