RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 NUDT12Q9BQG2 462 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 IL21Q9HBE4 155 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 FKBPLQ9UIM3 349 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF516Q92618 1163 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 ALG2Q9H553 416 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 EVA1BQ9NVM1 165 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 CTHP32929 405 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 SOX11P35716 441 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 KCNH2Q12809 1159 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO45P0C2W1 286 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 NR1H3Q13133 447 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 SLC6A16Q9GZN6 736 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 ZBBXA8MT70 800 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 ARMC2Q8NEN0 867 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 NBPF14Q5TI25 921 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 UCN2Q96RP3 112 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 HCSTQ9UBK5 93 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 S1PR4O95977 384 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 SEMA3FQ13275 785 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 PDXDC2PQ6P474 469 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 NKX2-3Q8TAU0 364 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 UNC93B1Q9H1C4 597 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 GPSM3Q9Y4H4 160 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 PTK2Q05397 1052 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 OCSTAMPQ9BR26 566 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 KCNC4Q03721 635 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 PBXIP1Q96AQ6 731 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 RFX1P22670 979 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 ADAM32Q8TC27 787 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF592Q92610 1267 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-205ENST00000391970 PIK3CDO00329 1044 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 ATP9BO43861 1147 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF511Q8NB15 262 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 RETREG2Q8NC44 543 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 BAP1Q92560 729 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 RNF223E7ERA6 249 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 LINC01559Q495D7 138 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB33Q86T24 672 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 FAM174AQ8TBP5 190 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 CEP126Q9P2H0 1117 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 GGCXP38435 758 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 ERFEQ4G0M1 354 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 PLA2G2CQ5R387 149 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 ANKLE1Q8NAG6 615 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 FOXJ1Q92949 421 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 CARD14Q9BXL6 1004 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 USP17L3A6NCW0 530 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 USP17L4A6NCW7 530 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 USP17L5A8MUK1 530 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 SKIP12755 728 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 SH3BP2P78314 561 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 AGERQ15109 404 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 SLFNL1Q499Z3 407 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 USP17L2Q6R6M4 530 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 PHTF2Q8N3S3 785 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 TRAIPQ9BWF2 469 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM32Q13049 653 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R18Q6NYC8 613 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 RNF135Q8IUD6 432 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 CHIC2Q9UKJ5 165 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 ATG7O95352 703 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms