RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391266.1

RNU6-1254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1254P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C6orf118Q5T5N4 469 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SVOPQ8N4V2 548 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BAP1Q92560 729 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZFAND3Q9H8U3 227 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DNMT3LQ9UJW3 386 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MSTNO14793 375 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HOXA2O43364 376 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 VARSP26640 1264 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MARSP56192 900 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ITPKCQ96DU7 683 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CFAP44Q96MT7 982 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SPOCK3Q9BQ16 436 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UNC93B1Q9H1C4 597 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PROCP04070 461 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCNYL3P0C7X3 344 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BMP2P12643 396 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 USP46P62068 366 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RETREG3Q86VR2 466 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 Q8N3U1 123 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF511Q8NB15 262 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CDK15Q96Q40 435 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EVA1BQ9NVM1 165 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NR3C2P08235 984 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PTSQ03393 145 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KCNH2Q12809 1159 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LYPD4Q6UWN0 246 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LINC00528Q8N1L1 170 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DCAF5Q96JK2 942 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MS4A1P11836 297 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GRM5P41594 1212 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PTPRNQ16849 979 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 VWA5B2Q8N398 1253 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MEIOBQ8N635 442 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCDC155Q8N6L0 562 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM174AQ8TBP5 190 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCDHGC3Q9UN70 934 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC35F4A4IF30 521 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TTLL8A6PVC2 850 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ADAMTS2O95450 1211 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NR5A1Q13285 461 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ARID5BQ14865 1188 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LCE3BQ5TA77 95 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FOXJ1Q92949 421 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FIGNL2A6NMB9 653 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SPTLC1O15269 473 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UPP2O95045 317 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ITGA6P23229 1130 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C4orf48Q5BLP8 95 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C6orf229H3BNL8 230 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FDX1P10109 184 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BAG6P46379 1132 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SV2AQ7L0J3 742 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GALNT6Q8NCL4 622 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CDC14CA4D256 554 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PHF20L1A8MW92 1017 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FURINP09958 794 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MAP3K10Q02779 954 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GAS6Q14393 721 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DESI1Q6ICB0 168 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRR7Q8TB68 274 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KRBA1A5PL33 1030 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SPINT1O43278 529 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NDUFV2P19404 249 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SMYD5Q6GMV2 418 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LYPD8Q6UX82 237 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NUTM1Q86Y26 1132 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ENAMQ9NRM1 1142 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 F12P00748 615 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FSHRP23945 695 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ITGB7P26010 798 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CTHP32929 405 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MAP2K5Q13163 448 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CBLBQ13191 982 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 Q6ZVU0 165 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GPIHBP1Q8IV16 184 aa2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.9 ms