RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 LMO7Q8WWI1 1683 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 BAG6P46379 1132 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITSN1Q15811 1721 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 RGPD5Q99666 1765 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 DLC1Q96QB1 1528 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHD4Q14839 1912 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC37A3O60309 1634 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM37O94972 964 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 TULP4Q9NRJ4 1543 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGEF10O15013 1369 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHRNA2Q15822 529 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRAM1Q96QH2 718 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.21□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATP7BP35670 1465 aa8.21□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 AKAP12Q02952 1782 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA0232Q92628 1395 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEP350Q5VT06 3117 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 YY1P25490 414 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 PSME1Q06323 249 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 STRN4Q9NRL3 753 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL18A1P39060 1754 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 APBA3O96018 575 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP35Q9P2H5 1018 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 SSH2Q76I76 1423 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 MPHOSPH9Q99550 1183 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 SIRT1Q96EB6 747 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 KAT6BQ8WYB5 2073 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIK3C2AO00443 1686 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 PAPPAQ13219 1627 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 POGKQ9P215 609 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 BTAF1O14981 1849 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNQ2O43526 872 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 PROM2Q8N271 834 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP19O94966 1318 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB7AO95365 584 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTGER2P43116 358 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 BARGINQ6ZT62 677 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 NHSQ6T4R5 1651 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLIT3O75094 1523 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPON1Q9HCB6 807 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 CPDO75976 1380 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACEP12821 1306 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 LTN1O94822 1766 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDE3BQ13370 1112 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRB1P82279 1406 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.6 ms