RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
FAAP20-202ENST00000378546 GLI3P10071 1580 aa36.56■■■■□ 3.44
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC61Q9Y6R9 512 aa36.55■■■■□ 3.44
FAAP20-202ENST00000378546 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
FAAP20-202ENST00000378546 FAM83GA6ND36 823 aa36.51■■■■□ 3.44
FAAP20-202ENST00000378546 ACEP12821 1306 aa36.51■■■■□ 3.43
FAAP20-202ENST00000378546 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.51■■■■□ 3.43
FAAP20-202ENST00000378546 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
FAAP20-202ENST00000378546 VPS72Q15906 364 aa36.49■■■■□ 3.43
FAAP20-202ENST00000378546 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
FAAP20-202ENST00000378546 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.48■■■■□ 3.43
FAAP20-202ENST00000378546 CABP2Q9NPB3 220 aa36.47■■■■□ 3.43
FAAP20-202ENST00000378546 NRAPQ86VF7 1730 aa36.46■■■■□ 3.43
FAAP20-202ENST00000378546 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.45■■■■□ 3.43
FAAP20-202ENST00000378546 BTG4Q9NY30 223 aa36.45■■■■□ 3.43
FAAP20-202ENST00000378546 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.42
FAAP20-202ENST00000378546 PLEKHG3A1L390 1219 aa36.44■■■■□ 3.42
FAAP20-202ENST00000378546 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.44■■■■□ 3.42
FAAP20-202ENST00000378546 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.43■■■■□ 3.42
FAAP20-202ENST00000378546 A0A0G2JS52 829 aa36.41■■■■□ 3.42
FAAP20-202ENST00000378546 MYT1Q01538 1121 aa36.41■■■■□ 3.42
FAAP20-202ENST00000378546 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.39■■■■□ 3.42
FAAP20-202ENST00000378546 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
FAAP20-202ENST00000378546 TONSLQ96HA7 1378 aa36.39■■■■□ 3.42
FAAP20-202ENST00000378546 EVC2Q86UK5 1308 aa36.38■■■■□ 3.41
FAAP20-202ENST00000378546 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.38■■■■□ 3.41
FAAP20-202ENST00000378546 ABTB2Q8N961 1025 aa36.37■■■■□ 3.41
FAAP20-202ENST00000378546 KIAA0232Q92628 1395 aa36.36■■■■□ 3.41
FAAP20-202ENST00000378546 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
FAAP20-202ENST00000378546 CABP1Q9NZU7 370 aa36.32■■■■□ 3.4
FAAP20-202ENST00000378546 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.31■■■■□ 3.4
FAAP20-202ENST00000378546 CHRNA2Q15822 529 aa36.3■■■■□ 3.4
FAAP20-202ENST00000378546 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
FAAP20-202ENST00000378546 EP400Q96L91 3159 aa36.29■■■■□ 3.4
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC125Q86Z20 511 aa36.28■■■■□ 3.4
FAAP20-202ENST00000378546 USP6P35125 1406 aa36.26■■■■□ 3.4
FAAP20-202ENST00000378546 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.26■■■■□ 3.4
FAAP20-202ENST00000378546 NLRP13Q86W25 1043 aa36.26■■■■□ 3.4
FAAP20-202ENST00000378546 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.26■■■■□ 3.4
FAAP20-202ENST00000378546 STRN4Q9NRL3 753 aa36.26■■■■□ 3.4
FAAP20-202ENST00000378546 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.39
FAAP20-202ENST00000378546 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
FAAP20-202ENST00000378546 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.23■■■■□ 3.39
FAAP20-202ENST00000378546 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.23■■■■□ 3.39
FAAP20-202ENST00000378546 USP19O94966 1318 aa36.22■■■■□ 3.39
FAAP20-202ENST00000378546 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
FAAP20-202ENST00000378546 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
FAAP20-202ENST00000378546 EVA1CP58658 441 aa36.19■■■■□ 3.38
FAAP20-202ENST00000378546 NLRP6P59044 892 aa36.17■■■■□ 3.38
FAAP20-202ENST00000378546 CPDO75976 1380 aa36.16■■■■□ 3.38
FAAP20-202ENST00000378546 ZBTB7CA1YPR0 619 aa36.16■■■■□ 3.38
FAAP20-202ENST00000378546 AKAP12Q02952 1782 aa36.16■■■■□ 3.38
FAAP20-202ENST00000378546 GCP02774 474 aa36.15■■■■□ 3.38
FAAP20-202ENST00000378546 PIK3C2AO00443 1686 aa36.14■■■■□ 3.38
FAAP20-202ENST00000378546 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.14■■■■□ 3.38
FAAP20-202ENST00000378546 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa36.13■■■■□ 3.37
FAAP20-202ENST00000378546 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.13■■■■□ 3.37
FAAP20-202ENST00000378546 USP35Q9P2H5 1018 aa36.13■■■■□ 3.37
FAAP20-202ENST00000378546 SSH2Q76I76 1423 aa36.13■■■■□ 3.37
FAAP20-202ENST00000378546 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.12■■■■□ 3.37
FAAP20-202ENST00000378546 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36.11■■■■□ 3.37
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
FAAP20-202ENST00000378546 SLIT3O75094 1523 aa36.09■■■■□ 3.37
FAAP20-202ENST00000378546 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.08■■■■□ 3.37
FAAP20-202ENST00000378546 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
FAAP20-202ENST00000378546 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa36.06■■■■□ 3.36
FAAP20-202ENST00000378546 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
FAAP20-202ENST00000378546 DEFB132Q7Z7B7 95 aa36.05■■■■□ 3.36
FAAP20-202ENST00000378546 MON2Q7Z3U7 1717 aa36.03■■■■□ 3.36
FAAP20-202ENST00000378546 FAM182BQ5T319 152 aa36.03■■■■□ 3.36
FAAP20-202ENST00000378546 TTC21AQ8NDW8 1320 aa36.03■■■■□ 3.36
FAAP20-202ENST00000378546 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
FAAP20-202ENST00000378546 TMC1Q8TDI8 760 aa36.02■■■■□ 3.36
FAAP20-202ENST00000378546 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
FAAP20-202ENST00000378546 SOX12O15370 315 aa36.01■■■■□ 3.36
FAAP20-202ENST00000378546 RGPD1P0DJD0 1748 aa36■■■■□ 3.35
FAAP20-202ENST00000378546 TCP11L2Q8N4U5 519 aa35.99■■■■□ 3.35
FAAP20-202ENST00000378546 BAG6P46379 1132 aa35.97■■■■□ 3.35
FAAP20-202ENST00000378546 BARGINQ6ZT62 677 aa35.97■■■■□ 3.35
FAAP20-202ENST00000378546 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.97■■■■□ 3.35
FAAP20-202ENST00000378546 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.96■■■■□ 3.35
FAAP20-202ENST00000378546 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.95■■■■□ 3.35
FAAP20-202ENST00000378546 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
FAAP20-202ENST00000378546 CRB1P82279 1406 aa35.93■■■■□ 3.34
FAAP20-202ENST00000378546 PDE3BQ13370 1112 aa35.93■■■■□ 3.34
FAAP20-202ENST00000378546 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
FAAP20-202ENST00000378546 COL18A1P39060 1754 aa35.89■■■■□ 3.34
FAAP20-202ENST00000378546 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.89■■■■□ 3.34
FAAP20-202ENST00000378546 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.89■■■■□ 3.34
FAAP20-202ENST00000378546 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa35.89■■■■□ 3.34
FAAP20-202ENST00000378546 FAM196AQ6ZSG2 479 aa35.88■■■■□ 3.33
FAAP20-202ENST00000378546 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.88■■■■□ 3.33
FAAP20-202ENST00000378546 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.88■■■■□ 3.33
FAAP20-202ENST00000378546 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
FAAP20-202ENST00000378546 NFAT5O94916 1531 aa35.86■■■■□ 3.33
FAAP20-202ENST00000378546 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
FAAP20-202ENST00000378546 RGPD5Q99666 1765 aa35.85■■■■□ 3.33
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.85■■■■□ 3.33
FAAP20-202ENST00000378546 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.85■■■■□ 3.33
FAAP20-202ENST00000378546 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms