RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376504.3

PTF1A-201, Transcript of pancreas associated transcription factor 1a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTF1A, Length 1,537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1A-201ENST00000376504 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
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PTF1A-201ENST00000376504 PSME1Q06323 249 aa43.5■■■■■ 4.55
PTF1A-201ENST00000376504 MIER1Q8N108 512 aa43.5■■■■■ 4.55
PTF1A-201ENST00000376504 NSD2O96028 1365 aa43.5■■■■■ 4.55
PTF1A-201ENST00000376504 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa43.49■■■■■ 4.55
PTF1A-201ENST00000376504 PARD3Q8TEW0 1356 aa43.48■■■■■ 4.55
PTF1A-201ENST00000376504 NHSL1Q5SYE7 1610 aa43.47■■■■■ 4.55
PTF1A-201ENST00000376504 TTC21AQ8NDW8 1320 aa43.47■■■■■ 4.55
PTF1A-201ENST00000376504 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
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PTF1A-201ENST00000376504 NPHP3Q7Z494 1330 aa43.45■■■■■ 4.55
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PTF1A-201ENST00000376504 KRT28Q7Z3Y7 464 aa43.44■■■■■ 4.54
PTF1A-201ENST00000376504 PXDNQ92626 1479 aa43.44■■■■■ 4.54
PTF1A-201ENST00000376504 GGNBP2Q9H3C7 697 aa43.43■■■■■ 4.54
PTF1A-201ENST00000376504 TOM1O60784 492 aa43.43■■■■■ 4.54
PTF1A-201ENST00000376504 RALBP1Q15311 655 aa43.42■■■■■ 4.54
PTF1A-201ENST00000376504 ZRANB1Q9UGI0 708 aa43.39■■■■■ 4.54
PTF1A-201ENST00000376504 USP54Q70EL1 1684 aa43.38■■■■■ 4.53
PTF1A-201ENST00000376504 ALS2Q96Q42 1657 aa43.38■■■■■ 4.53
PTF1A-201ENST00000376504 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
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PTF1A-201ENST00000376504 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
PTF1A-201ENST00000376504 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa43.34■■■■■ 4.53
PTF1A-201ENST00000376504 OVOS2Q6IE36 1432 aa43.34■■■■■ 4.53
PTF1A-201ENST00000376504 SBNO1A3KN83 1393 aa43.34■■■■■ 4.53
PTF1A-201ENST00000376504 USP31Q70CQ4 1352 aa43.34■■■■■ 4.53
PTF1A-201ENST00000376504 MORC1Q86VD1 984 aa43.33■■■■■ 4.53
PTF1A-201ENST00000376504 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
PTF1A-201ENST00000376504 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.53
PTF1A-201ENST00000376504 ABTB2Q8N961 1025 aa43.28■■■■■ 4.52
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PTF1A-201ENST00000376504 TNS3Q68CZ2 1445 aa43.26■■■■■ 4.52
PTF1A-201ENST00000376504 PIP4K2BP78356 416 aa43.26■■■■■ 4.52
PTF1A-201ENST00000376504 NLRP6P59044 892 aa43.23■■■■■ 4.51
PTF1A-201ENST00000376504 NUTM2GQ5VZR2 741 aa43.23■■■■■ 4.51
PTF1A-201ENST00000376504 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa43.23■■■■■ 4.51
PTF1A-201ENST00000376504 PPP2R1AP30153 589 aa43.22■■■■■ 4.51
PTF1A-201ENST00000376504 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
PTF1A-201ENST00000376504 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
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PTF1A-201ENST00000376504 LMOD2Q6P5Q4 547 aa43.16■■■■■ 4.5
PTF1A-201ENST00000376504 NLRP13Q86W25 1043 aa43.15■■■■■ 4.5
PTF1A-201ENST00000376504 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
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PTF1A-201ENST00000376504 ARHGEF10O15013 1369 aa43.13■■■■■ 4.49
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PTF1A-201ENST00000376504 SLIT3O75094 1523 aa43.12■■■■■ 4.49
PTF1A-201ENST00000376504 AATKQ6ZMQ8 1374 aa43.12■■■■■ 4.49
PTF1A-201ENST00000376504 FBLN1P23142 703 aa43.12■■■■■ 4.49
PTF1A-201ENST00000376504 USP19O94966 1318 aa43.11■■■■■ 4.49
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PTF1A-201ENST00000376504 MTHFSP49914 203 aa43.02■■■■■ 4.48
PTF1A-201ENST00000376504 POLKQ9UBT6 870 aa43.02■■■■■ 4.48
PTF1A-201ENST00000376504 ABCA3Q99758 1704 aa43.01■■■■■ 4.48
PTF1A-201ENST00000376504 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
PTF1A-201ENST00000376504 MRS2Q9HD23 443 aa43■■■■■ 4.47
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PTF1A-201ENST00000376504 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa42.98■■■■■ 4.47
PTF1A-201ENST00000376504 PEAK1Q9H792 1746 aa42.98■■■■■ 4.47
PTF1A-201ENST00000376504 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
PTF1A-201ENST00000376504 PLEKHG5O94827 1062 aa42.97■■■■■ 4.47
PTF1A-201ENST00000376504 GCP02774 474 aa42.97■■■■■ 4.47
PTF1A-201ENST00000376504 KCNH5Q8NCM2 988 aa42.97■■■■■ 4.47
PTF1A-201ENST00000376504 PNPLA6Q8IY17 1366 aa42.94■■■■■ 4.46
PTF1A-201ENST00000376504 CABLES1Q8TDN4 633 aa42.94■■■■■ 4.46
PTF1A-201ENST00000376504 MAP3K19Q56UN5 1328 aa42.93■■■■■ 4.46
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PTF1A-201ENST00000376504 HSPA1LP34931 641 aa42.79■■■■■ 4.44
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PTF1A-201ENST00000376504 CPDO75976 1380 aa42.78■■■■■ 4.44
PTF1A-201ENST00000376504 COL18A1P39060 1754 aa42.78■■■■■ 4.44
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PTF1A-201ENST00000376504 JCADQ9P266 1359 aa42.74■■■■■ 4.43
PTF1A-201ENST00000376504 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa42.74■■■■■ 4.43
PTF1A-201ENST00000376504 RGPD5Q99666 1765 aa42.74■■■■■ 4.43
PTF1A-201ENST00000376504 KIAA0232Q92628 1395 aa42.73■■■■■ 4.43
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PTF1A-201ENST00000376504 ZBTB7CA1YPR0 619 aa42.72■■■■■ 4.43
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