RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 BCAR3O75815 825 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 SMARCE1Q969G3 411 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 H0YHG0 523 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO3Q9UK99 471 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 ODF2Q5BJF6 829 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 FILIP1LQ4L180 1135 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKAR2BP31323 418 aa28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 SART3Q15020 963 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 DCTN1Q14203 1278 aa28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 GRPEL1Q9HAV7 217 aa28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 IGF1RP08069 1367 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 GNAI2P04899 355 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 NCOA2Q15596 1464 aa28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 STK38Q15208 465 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC192P0DO97 292 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 CALRP27797 417 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.81■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP2B1P20020 1258 aa28.8■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 MTMR7Q9Y216 660 aa28.79■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.79■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO6Q9UM54 1294 aa28.78■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.78■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa28.78■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.78■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 LEKR1Q6ZMV7 388 aa28.77■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.77■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 TNMDQ9H2S6 317 aa28.77■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.77■■■□□ 2.2
GNPTAB-201ENST00000299314 PRDM2Q13029 1718 aa28.76■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.76■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa28.75■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 SKIDA1Q1XH10 827 aa28.75■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINC1P01008 464 aa28.75■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 NLRP6P59044 892 aa28.75■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 RDXP35241 583 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.74■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.74■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.74■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 TXLNAP40222 546 aa28.73■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 STK3Q13188 491 aa28.73■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD1Q15327 319 aa28.72■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC112Q8NEF3 446 aa28.72■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC4A2P04920 1241 aa28.72■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 MPNDQ8N594 471 aa28.71■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 UQCRHLA0A096LP55 91 aa28.71■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 UQCRHP07919 91 aa28.71■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa28.71■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 JMYQ8N9B5 988 aa28.71■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.7■■■□□ 2.19
GNPTAB-201ENST00000299314 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR63Q8IWG1 891 aa28.7■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.183e-9■■■■■ 260.8
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT85P78386 507 aa28.69■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC39AQ5SRH9 613 aa28.69■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.68■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPYL1Q9H0U9 437 aa28.68■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.68■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ME1P48163 572 aa28.68■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 MCM4P33991 863 aa28.67■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 PPFIBP1Q86W92 1011 aa28.67■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 DACH1Q9UI36 760 aa28.66■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.66■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC158Q5M9N0 1113 aa28.66■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 PKNOX2Q96KN3 472 aa28.64■■■□□ 2.18
GNPTAB-201ENST00000299314 IKQ13123 557 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.63■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.62■■■□□ 2.17
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