RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297436.2

DEFA6-201, Transcript of defensin alpha 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DEFA6, Length 469 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6-201ENST00000297436 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
DEFA6-201ENST00000297436 SEC24BO95487 1268 aa9.98□□□□□ -0.81
DEFA6-201ENST00000297436 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.98□□□□□ -0.81
DEFA6-201ENST00000297436 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.98□□□□□ -0.81
DEFA6-201ENST00000297436 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.98□□□□□ -0.81
DEFA6-201ENST00000297436 KIF3BO15066 747 aa9.97□□□□□ -0.81
DEFA6-201ENST00000297436 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
DEFA6-201ENST00000297436 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.97□□□□□ -0.81
DEFA6-201ENST00000297436 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.97□□□□□ -0.81
DEFA6-201ENST00000297436 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.96□□□□□ -0.81
DEFA6-201ENST00000297436 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
DEFA6-201ENST00000297436 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 MCM4P33991 863 aa9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 MLECQ14165 292 aa9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 ZNF428Q96B54 188 aa9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 POGKQ9P215 609 aa9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 EVC2Q86UK5 1308 aa9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 KIF16BQ96L93 1317 aa9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 ZFYVE9O95405 1425 aa9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.96□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.95□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 RLBP1P12271 317 aa9.95□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 SMC5Q8IY18 1101 aa9.95□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.95□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 SNX21Q969T3 373 aa9.95□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 MTHFSP49914 203 aa9.94□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 MRE11P49959 708 aa9.94□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.94□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.94□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.93□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.93□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 ABCC3O15438 1527 aa9.92□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.92□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.92□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 HSCBQ8IWL3 235 aa9.92□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 CFAP44Q96MT7 982 aa9.92□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.91□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 CLCN1P35523 988 aa9.91□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 DDIT3P35638 169 aa9.91□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.91□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.91□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.9□□□□□ -0.82
DEFA6-201ENST00000297436 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 PIK3R4Q99570 1358 aa9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 TRAK2O60296 914 aa9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 NUCB1Q02818 461 aa9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 SMC4Q9NTJ3 1288 aa9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 TRIM27P14373 513 aa9.88□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 NEUROD2Q15784 382 aa9.88□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 BMP2KLQ5H9B9 411 aa9.88□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.88□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 GCC1Q96CN9 775 aa9.88□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 GBP4Q96PP9 640 aa9.88□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.88□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.87□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.87□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.87□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 TNNQ9UQP3 1299 aa9.87□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 PTCH1Q13635 1447 aa9.87□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.86□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 GRPEL1Q9HAV7 217 aa9.86□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.86□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 A0A1W2PP64 1363 aa9.86□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.85□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 ITPRIPQ8IWB1 547 aa9.85□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.85□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.84□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 FCHSD2O94868 740 aa9.84□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.84□□□□□ -0.83
DEFA6-201ENST00000297436 CHD1LQ86WJ1 897 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms