RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262462.8

SLC27A6-201, Transcript of solute carrier family 27 member 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC27A6, Length 3,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6-201ENST00000262462 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 PBRM1Q86U86 1689 aa20.24■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 IGSF3O75054 1194 aa20.24■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.24■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 PLCB2Q00722 1185 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 NUP160Q12769 1436 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 GPT2Q8TD30 523 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 NUCB2P80303 420 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SLC27A6-201ENST00000262462 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 SYNMO15061 1565 aa20.2■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.2■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.2■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 HS1BP3Q53T59 392 aa20.2■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.19■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 ATP10BO94823 1461 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 CDC45O75419 566 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 PLXNC1O60486 1568 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 SYNJ2O15056 1496 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 LAMC1P11047 1609 aa20.14■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 RABEP1Q15276 862 aa20.14■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 CCDC27Q2M243 656 aa20.14■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.14■□□□□ 0.82
SLC27A6-201ENST00000262462 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 DMTNQ08495 405 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 GRIN2AQ12879 1464 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 ST18O60284 1047 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 ERVK-7P63135 1459 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 GCC1Q96CN9 775 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 USP25Q9UHP3 1055 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 MCM5P33992 734 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 FGD1P98174 961 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 ATP2B3Q16720 1220 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 TSPY26PQ9H489 355 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC27A6-201ENST00000262462 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 NEK4P51957 841 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 USP26Q9BXU7 913 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 MYOM1P52179 1685 aa20.05■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.05■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 KIF3AQ9Y496 699 aa20.05■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 SLC24A1O60721 1099 aa20.04■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.04■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.04■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 CABP2Q9NPB3 220 aa20.04■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 AFAP1Q8N556 730 aa20.03■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 TSPYL6Q8N831 410 aa20.03■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 MADDQ8WXG6 1647 aa20.02■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SLC27A6-201ENST00000262462 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms