RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa8.37□□□□□ -1.07
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Terf2O35144 541 aa8.34□□□□□ -1.07
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map7O88735 730 aa8.33□□□□□ -1.08
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc60Q8C4J0 545 aa8.33□□□□□ -1.08
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kif18aQ91WD7 886 aa8.33□□□□□ -1.08
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nrxn1Q9CS84 1514 aa8.32□□□□□ -1.08
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nutm1Q8BHP2 1126 aa8.32□□□□□ -1.08
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cog6Q8R3I3 657 aa8.32□□□□□ -1.08
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gli2Q0VGT2 1544 aa8.32□□□□□ -1.08
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akap12Q9WTQ5 1684 aa8.32□□□□□ -1.08
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stk26Q99JT2 416 aa8.31□□□□□ -1.08
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa8.3□□□□□ -1.08
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa8.3□□□□□ -1.08
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nectin2P32507 530 aa8.29□□□□□ -1.08
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kif20aP97329 887 aa8.29□□□□□ -1.08
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 FanciQ8K368 1330 aa8.28□□□□□ -1.08
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptch1Q61115 1434 aa8.28□□□□□ -1.08
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa8.28□□□□□ -1.08
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp1b4Q99ME6 356 aa8.28□□□□□ -1.08
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa8.27□□□□□ -1.09
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa8.27□□□□□ -1.09
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10093D3YYI8 482 aa8.27□□□□□ -1.09
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nsd3Q6P2L6 1439 aa8.27□□□□□ -1.09
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Knl1Q66JQ7 1612 aa8.26□□□□□ -1.09
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GorabQ8BRM2 368 aa8.26□□□□□ -1.09
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PaskQ8CEE6 1383 aa8.26□□□□□ -1.09
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pik3r4Q8VD65 1358 aa8.26□□□□□ -1.09
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cep170bQ80U49 1574 aa8.26□□□□□ -1.09
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AdgbG3UZ78 1657 aa8.26□□□□□ -1.09
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NinlQ6ZQ12 1394 aa8.26□□□□□ -1.09
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