RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 INCA1Q0VD86 236 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ACAP1Q15027 740 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 GEN1Q17RS7 908 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF569Q5MCW4 686 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 SLCO6A1Q86UG4 719 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 RGL4Q8IZJ4 473 aa25.08■■□□□ 1.61
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CAPNS1-216ENST00000628306 WDR24Q96S15 920 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
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CAPNS1-216ENST00000628306 IL12RB1P42701 662 aa25.07■■□□□ 1.6
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CAPNS1-216ENST00000628306 GLRX5Q86SX6 157 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC47A2Q86VL8 602 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF276Q8N554 614 aa25.07■■□□□ 1.6
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CAPNS1-216ENST00000628306 ITM2CQ9NQX7 267 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 SUSD2Q9UGT4 822 aa25.07■■□□□ 1.6
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CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G4AP47712 749 aa25.06■■□□□ 1.6
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CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM72Q6ZMU5 477 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf216Q8TAB5 229 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF592Q92610 1267 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 NOX5Q96PH1 765 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 ARID3AQ99856 593 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 PNPLA8Q9NP80 782 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.61e-21■■■■■ 79.2
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CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC4EQ9ULY5 219 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 USP3Q9Y6I4 520 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD62A6NC57 917 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 RTN2O75298 545 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 RDXP35241 583 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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CAPNS1-216ENST00000628306 WDR45BQ5MNZ6 344 aa25.05■■□□□ 1.6
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM215Q68D42 235 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM270Q6UE05 265 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 DBX2Q6ZNG2 339 aa25.04■■□□□ 1.6
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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CAPNS1-216ENST00000628306 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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CAPNS1-216ENST00000628306 NUMA1Q14980 2115 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL12A8MUP2 240 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 CLSTN1O94985 981 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKCHP24723 683 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF12L1Q5VU92 463 aa25.02■■□□□ 1.6
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