RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592647.1

TRAPPC6A-205, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-205ENST00000592647 DRGXA6NNA5 263 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CNTN5O94779 1100 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TPI1P60174 286 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ALFQ53S48 1182 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ODF2Q5BJF6 829 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 LRRC38Q5VT99 294 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 DMXL1Q9Y485 3027 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 H0Y626 953 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 DAPK3O43293 454 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 LAMTOR5O43504 91 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 PSTPIP1O43586 416 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 KRT1P04264 644 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 EPHB2P29323 1055 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 MARCKSL1P49006 195 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 DPYSL2Q16555 572 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 GAB4Q2WGN9 574 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 HS1BP3Q53T59 392 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ARTNQ5T4W7 220 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 C12orf40Q86WS4 652 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 DCLK2Q8N568 766 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 RAPGEF5Q92565 580 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 KRT35Q92764 455 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CD101Q93033 1021 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 LRRD1A4D1F6 860 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 H3BRJ5 948 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CD48P09326 243 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 GOT1P17174 413 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ARL4AP40617 200 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 DNA2P51530 1060 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 MMRN1Q13201 1228 aa22.08■■□□□ 1.13
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 C5orf22Q49AR2 442 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 MANEALQ5VSG8 457 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TRIM58Q8NG06 486 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CHFRQ96EP1 664 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CALN1Q9BXU9 219 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-205ENST00000592647 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TRIM24O15164 1050 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 KIF5CO60282 957 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 KDELR1P24390 212 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CTNNA2P26232 953 aa22.07■■□□□ 1.12
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 ARSEP51690 589 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CDH4P55283 916 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 AMPD2Q01433 879 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 KDSRQ06136 332 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 PDK2Q15119 407 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 MPP7Q5T2T1 576 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 RFX8Q6ZV50 586 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 MFN1Q8IWA4 741 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 A0A1B0GVM2 712 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CCDC66A2RUB6 948 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TCAF2A6NFQ2 919 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 FAM170BA6NMN3 283 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CACNG3O60359 315 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TULP3O75386 442 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CLDN11O75508 207 aa22.06■■□□□ 1.12
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