RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 BEND5Q7L4P6 421 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 ADIPOR2Q86V24 386 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 ERICH1Q86X53 443 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 NEK11Q8NG66 645 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 OR2T3Q8NH03 318 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 GANCQ8TET4 914 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 CPA5Q8WXQ8 436 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 AZIN2Q96A70 460 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC2A13Q96QE2 648 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 STK33Q9BYT3 514 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 SIK2Q9H0K1 926 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 GANQ9H2C0 597 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 MTG2Q9H4K7 406 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 CD248Q9HCU0 757 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM74BQ9NUR3 256 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 ASNSD1Q9NWL6 643 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 VANGL2Q9ULK5 521 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 STAP1Q9ULZ2 295 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNU1A8MYU2 1149 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 EPHB6O15197 1021 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV3-25P01717 112 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 PDGFRAP16234 1089 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 MAOBP27338 520 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 TPMTP51580 245 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 COPAP53621 1224 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 DEUP1Q05D60 604 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPRNQ16849 979 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 PITRM1Q5JRX3 1037 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 MPP7Q5T2T1 576 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 SYCP2LQ5T4T6 812 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC26A9Q7LBE3 791 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 FIBINQ8TAL6 211 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 EPS8L1Q8TE68 723 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 C18orf8Q96DM3 657 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 PRR14Q9BWN1 585 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1B0GVM2 712 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 TCAF2A6NFQ2 919 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 LGALS16A8MUM7 142 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 DNTTP04053 509 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 ASLP04424 464 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF18P17022 549 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 ENGP17813 658 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 NOS2P35228 1153 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 SOX5P35711 763 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 DPP6P42658 865 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 MATKP42679 507 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 STK19P49842 368 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 LIMK1P53667 647 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 ENPP2Q13822 863 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 CDO1Q16878 200 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 DUOXA1Q1HG43 343 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 PLEKHG6Q3KR16 790 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 XYLT1Q86Y38 959 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 APCDD1Q8J025 514 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC30A5Q8TAD4 765 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 TBCBQ99426 244 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM245Q9H330 911 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 PRSS16Q9NQE7 514 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 PIGVQ9NUD9 493 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms