RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 RRN3Q9NYV6 651 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PATE3B3GLJ2 98 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SLC30A4O14863 429 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 EPHB6O15197 1021 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PAGE1O75459 146 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV3-25P01717 112 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 DNTTP04053 509 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ASLP04424 464 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC172P0C7W6 258 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ATP1A3P13637 1013 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PDGFRAP16234 1089 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ITPKAP23677 461 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 OXTRP30559 389 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 GGCXP38435 758 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 DPP6P42658 865 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 GABRB2P47870 512 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NUMBP49757 651 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 TPMTP51580 245 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 OXCT1P55809 520 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 TPM4P67936 248 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NOMO3P69849 1222 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 IRX4P78413 519 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CDR2Q01850 454 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ENPP2Q13822 863 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NCAPHQ15003 741 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PTPRNQ16849 979 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FSCBQ5H9T9 825 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 BRMS1LQ5PSV4 323 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 STPG1Q5TH74 334 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FBXL22Q6P050 247 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FAM124AQ86V42 546 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 XYLT1Q86Y38 959 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 OR2T3Q8NH03 318 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 GANCQ8TET4 914 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FOXJ1Q92949 421 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRM-214ENST00000583153 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRM-214ENST00000583153 NPY6RQ99463 290 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 EDEM2Q9BV94 578 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NUP58Q9BVL2 599 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 GPR174Q9BXC1 333 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM245Q9H330 911 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CD248Q9HCU0 757 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CD93Q9NPY3 652 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 HS3ST4Q9Y661 456 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PI4KAP42356 2102 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GVM2 712 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 C4orf47A7E2U8 309 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 MEI4A8MW99 385 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ADCY5O95622 1261 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINC1P01008 464 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 GNSP15586 552 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CHRNB2P17787 502 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 MAOBP27338 520 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SCNN1AP37088 669 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 MAPK8P45983 427 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 COPAP53621 1224 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 JAM2P57087 298 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ATP11AP98196 1134 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ECT2LQ008S8 904 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 FMO1Q01740 532 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CENPCQ03188 943 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SLC12A1Q13621 1099 aa8.58□□□□□ -1.04
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