RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084		M0QYT0	321 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	GLP2R	O95838	553 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	SETSIP	P0DME0	302 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ST6GAL1	P15907	406 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	NPPB	P16860	134 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	KLRK1	P26718	216 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	PPM1A	P35813	382 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	GSTM5	P46439	218 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	VPS41	P49754	854 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	STIM1	Q13586	685 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	LAMB3	Q13751	1172 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	SKAP1	Q86WV1	359 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	CDC23	Q9UJX2	597 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TNS2	Q63HR2	1409 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	PRX	Q9BXM0	1461 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084		A0A0G2JK05	382 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	SOCS2	O14508	198 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	PIP5K1B	O14986	540 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	CER1	O95813	267 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	IGKV2-30	P06310	120 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TNFRSF1B	P20333	461 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	MTX1	Q13505	466 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	CSHL1	Q14406	222 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	AWAT2	Q6E213	333 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	PIGK	Q92643	395 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	CUL5	Q93034	780 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ZBTB9	Q96C00	473 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	GPR78	Q96P69	363 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	CEP83	Q9Y592	693 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	MYOM1	P52179	1685 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	AQP12B	A6NM10	295 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TTC34	A8MYJ7	566 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	NKX2-8	O15522	239 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	PPP6R2	O75170	966 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	WNT1	P04628	370 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	IGFBP2	P18065	325 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	CPA2	P48052	419 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	FOXL2	P58012	376 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	KRTAP10-9	P60411	292 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	B4GALNT1	Q00973	533 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	MTA1	Q13330	715 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TWIST1	Q15672	202 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	AAK1	Q2M2I8	961 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	P3H1	Q32P28	736 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	FAM57B	Q71RH2	274 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TRABD2A	Q86V40	505 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ZNF366	Q8N895	744 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	HMCES	Q96FZ2	354 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	MST1R	Q04912	1400 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	ADGRB2	O60241	1585 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COX11-208	ENST00000576084	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		3.86	□□□□□ -1.79

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