RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 TRIML2Q8N7C3 387 aa10.36□□□□□ -0.75
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TRPS1-211ENST00000520276 PLEKHA8Q96JA3 519 aa10.36□□□□□ -0.75
TRPS1-211ENST00000520276 SIAEQ9HAT2 523 aa10.36□□□□□ -0.75
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D23Q9NUY8 699 aa10.36□□□□□ -0.75
TRPS1-211ENST00000520276 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.36□□□□□ -0.75
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TRPS1-211ENST00000520276 NDST2P52849 883 aa10.35□□□□□ -0.75
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TRPS1-211ENST00000520276 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
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TRPS1-211ENST00000520276 USP33Q8TEY7 942 aa10.34□□□□□ -0.75
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TRPS1-211ENST00000520276 DCAKDQ8WVC6 231 aa10.34□□□□□ -0.75
TRPS1-211ENST00000520276 BADQ92934 168 aa10.34□□□□□ -0.75
TRPS1-211ENST00000520276 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TRPS1-211ENST00000520276 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.34□□□□□ -0.75
TRPS1-211ENST00000520276 Q9H521 79 aa10.34□□□□□ -0.75
TRPS1-211ENST00000520276 RAB26Q9ULW5 256 aa10.34□□□□□ -0.75
TRPS1-211ENST00000520276 RNF11Q9Y3C5 154 aa10.34□□□□□ -0.75
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