RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515918.1

RNU6-488P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 488, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-488P, Length 99 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-488P-201ENST00000515918 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 GAGE12BA1L429 117 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 WDR27A2RRH5 827 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 IFNL4K9M1U5 179 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 UBE2CO00762 179 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 ADAM20O43506 726 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 PDE8BO95263 885 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 APOA4P06727 396 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 MATN1P21941 496 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 UBA7P41226 1012 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 CPA2P48052 419 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 RPS6KA3P51812 740 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 GPC5P78333 572 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 EFNB1P98172 346 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 B4GALNT1Q00973 533 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 ITIH3Q06033 890 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 GOLGA8FQ08AF8 430 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 NEXNQ0ZGT2 675 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 LRMPQ12912 555 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 TAF11Q15544 211 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 SLC18A3Q16572 532 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 AP5B1Q2VPB7 878 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 SPDYE7PQ495Y7 208 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 FBXO43Q4G163 708 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 HECTD3Q5T447 861 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 CDC73Q6P1J9 531 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 KLHL35Q6PF15 583 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 C17orf99Q6UX52 265 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 NBPF11Q86T75 865 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 VSIG1Q86XK7 387 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 BRSK2Q8IWQ3 736 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 LAS2Q8IYD9 372 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 TEX11Q8IYF3 940 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 CCDC105Q8IYK2 499 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 KCTD6Q8NC69 237 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 WDFY2Q96P53 400 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 KLC2Q9H0B6 622 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 SIL1Q9H173 461 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 OR10A4Q9H209 315 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-488P-201ENST00000515918 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 A0A1W2PQF6 199 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 CES2O00748 559 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 SUV39H1O43463 412 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 PROM1O43490 865 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 TMPRSS11DO60235 418 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 LPXNO60711 386 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 ENTPD3O75355 529 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 CDKL5O76039 1030 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 NDUFA10O95299 355 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 HSPA4LO95757 839 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 TSPAN15O95858 294 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 C1RP00736 705 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 CYP4B1P13584 511 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 COMTP21964 271 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 DUSP1P28562 367 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 PCSK6P29122 969 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 GCH1P30793 250 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 JAK3P52333 1124 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 PPP5CP53041 499 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 NXPH1P58417 271 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 OLR1P78380 273 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 KRT83P78385 493 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 SHC2P98077 582 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-488P-201ENST00000515918 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms