RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 VAMP7P51809 220 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 PPP2CBP62714 309 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 PPP2CAP67775 309 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 DAB2P98082 770 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF394Q53GI3 561 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM129BQ96TA1 746 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 THSD1Q9NS62 852 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 KLK10O43240 276 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 OPA1O60313 960 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CKMT1AP12532 417 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC6A4P31645 630 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 DRD3P35462 400 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 PSMD8P48556 350 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 RAD23BP54727 409 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 SKOR1P84550 965 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CUL4BQ13620 913 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 HS1BP3Q53T59 392 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 SHC4Q6S5L8 630 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TRIM69Q86WT6 500 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC25A45Q8N413 288 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 EDEM1Q92611 657 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TTC34A8MYJ7 566 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 E7ENQ6 273 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 K7ENP7 123 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 ACSL4O60488 711 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CUTAO60888 179 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 SDC3O75056 442 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 USP12O75317 370 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 GCLMP48507 274 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 PPP3CAQ08209 521 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 ADIGQ0VDE8 80 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 STK4Q13043 487 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CEP135Q66GS9 1140 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 USP29Q9HBJ7 922 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CISHQ9NSE2 258 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1B0GVM2 712 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TULP2O00295 520 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 KLRC4O43908 158 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CSO75390 466 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 MOCS3O95396 460 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 YEATS4O95619 227 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 DGKAP23743 735 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 ECT2LQ008S8 904 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.052e-15■■■□□ 18.7
PRPF40A-211ENST00000493468 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CDH18Q13634 790 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 STAT4Q14765 748 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 NFIL3Q16649 462 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PRPF40A-211ENST00000493468 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms