RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 TMEM160Q9NX00 188 aa5.51□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5.51□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa5.51□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 AOX1Q06278 1338 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 VWA3AA6NCI4 1184 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 EYA2O00167 538 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 TIMM44O43615 452 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 RNF8O76064 485 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 SGPL1O95470 568 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 CSF1P09603 554 aa5.5□□□□□ -1.53
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CCL20-204ENST00000489160 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ACP5P13686 325 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 SHC2P98077 582 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 DLGAP5Q15398 846 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 HYIQ5T013 277 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ATG16L1Q676U5 607 aa5.5□□□□□ -1.53
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CCL20-204ENST00000489160 RFX6Q8HWS3 928 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 UEVLDQ8IX04 471 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ESX1Q8N693 406 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 GPATCH11Q8N954 259 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 NELL1Q92832 810 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 PPM1MQ96MI6 270 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 CLPBQ9H078 707 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 PRDM13Q9H4Q3 707 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ERVK-5Q9HDB9 667 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 NRBP1Q9UHY1 535 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 TISP43B9A030 160 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 NUDT3O95989 172 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 CPA1P15085 419 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 PTMSP20962 102 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 TNFAIP3P21580 790 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 TGM2P21980 687 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 TACR3P29371 465 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 IDUAP35475 653 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 B4GALNT1Q00973 533 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 TFF2Q03403 129 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 RUNDC3AQ59EK9 446 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ANO7Q6IWH7 933 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ZNF398Q8TD17 642 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ZG16BQ96DA0 208 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 EMSYQ7Z589 1322 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 LINC01548A6NM66 108 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 CCER2I3L3R5 266 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 RRHO14718 337 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 KLK10O43240 276 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
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CCL20-204ENST00000489160 PRPH2P23942 346 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 MAPK7Q13164 816 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 WDR45BQ5MNZ6 344 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 DHRS13Q6UX07 377 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 HASPINQ8TF76 798 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 HTRA1Q92743 480 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 KCNJ9Q92806 393 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ATP2A3Q93084 1043 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
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CCL20-204ENST00000489160 SUFUQ9UMX1 484 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 GDAQ9Y2T3 454 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 MCIDASD6RGH6 385 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 J3KRW8 73 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 DSCR3O14972 297 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 ANP32CO43423 234 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 USP12O75317 370 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 METTL18O95568 372 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 AKR1A1P14550 325 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 RPS6KA3P51812 740 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-204ENST00000489160 OAZ1P54368 228 aa5.47□□□□□ -1.53
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