RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 SPACA7Q96KW9 195 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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NELFE-208ENST00000481121 EPHX1P07099 455 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 CSKP41240 450 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 TRIM14Q14142 442 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 RAB6CQ53S08 254 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 LRRC31Q6UY01 552 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 HAPLN3Q96S86 360 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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NELFE-208ENST00000481121 ABCA7Q8IZY2 2146 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 CCP110O43303 1012 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 RTN2O75298 545 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 CLDN11O75508 207 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ASLP04424 464 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 DESP17661 470 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 NDUFV2P19404 249 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 OXCT1P55809 520 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 HDAC4P56524 1084 aa21.44■■□□□ 1.02
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NELFE-208ENST00000481121 SLC12A1Q13621 1099 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 PTPRNQ16849 979 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHG6Q3KR16 790 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 C5orf22Q49AR2 442 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 KBTBD6Q86V97 674 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 C11orf74Q86VG3 221 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 TTC17Q96AE7 1141 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 C1orf74Q96LT6 269 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 PARVAQ9NVD7 372 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 INVSQ9Y283 1065 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 E9PAM4 449 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 DCLK1O15075 740 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 CDH4P55283 916 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ST8SIA6P61647 398 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ZNF653Q96CK0 615 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 TRIM11Q96F44 468 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 TMEM245Q9H330 911 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 HLA-EP13747 358 aa21.42■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 P2RY2P41231 377 aa21.42■■□□□ 1.02
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NELFE-208ENST00000481121 ZNF366Q8N895 744 aa21.42■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 RLN3Q8WXF3 142 aa21.42■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.42■■□□□ 1.02
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NELFE-208ENST00000481121 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.42■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.41■■□□□ 1.02
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NELFE-208ENST00000481121 CNTN5O94779 1100 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 TPM1P09493 284 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ADRA1BP35368 520 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 MAMLD1Q13495 774 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 PLK5Q496M5 336 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ALFQ53S48 1182 aa21.41■■□□□ 1.02
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NELFE-208ENST00000481121 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 DCLK2Q8N568 766 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ISCUQ9H1K1 167 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 SCINQ9Y6U3 715 aa21.41■■□□□ 1.02
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NELFE-208ENST00000481121 RETP07949 1114 aa21.4■■□□□ 1.02
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NELFE-208ENST00000481121 CCDC185Q8N715 623 aa21.4■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 NTAN1Q96AB6 310 aa21.4■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.4■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 MPP6Q9NZW5 540 aa21.4■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ERVW-1Q9UQF0 538 aa21.4■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 DRGXA6NNA5 263 aa21.39■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 ZNF217O75362 1048 aa21.39■■□□□ 1.02
NELFE-208ENST00000481121 RHOBTB1O94844 696 aa21.39■■□□□ 1.02
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