RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 NRN1LQ496H8 165 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CRY2Q49AN0 593 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 SPECC1Q5M775 1068 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 MFSD5Q6N075 450 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR135Q8IZ08 494 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CXorf38Q8TB03 319 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 HMGB4Q8WW32 186 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 STAMQ92783 540 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 NELL1Q92832 810 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 GNRHR2Q96P88 292 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR24Q96S15 920 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF536O15090 1300 aa6.16□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 PSME4Q14997 1843 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1W2PRQ8 180 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1W2PRX2 142 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 H3BNC9 293 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CBFA2T3O75081 653 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 SGPL1O95470 568 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CSF1RP07333 972 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CPA1P15085 419 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 AKR1B1P15121 316 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 HK1P19367 917 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 HTR7P34969 479 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CDK7P50613 346 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 LOXL3P58215 753 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 LAYNQ6UX15 382 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 SYT12Q8IV01 421 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 NGEFQ8N5V2 710 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 TTPALQ9BTX7 342 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.15□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 CACNA1HO95180 2353 aa6.15□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA0355O15063 1070 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPAN3O60637 253 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 MLYCDO95822 493 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ITGB3P05106 788 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 GCSHP23434 173 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 CHMP24386 653 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ACTN2P35609 894 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 GGT5P36269 586 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 PGDP52209 483 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 PRKAG1P54619 331 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 MC2RQ01718 297 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 PIGFQ07326 219 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC39A6Q13433 755 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGEF6Q15052 776 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC24Q50LG9 513 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 METRNLQ641Q3 311 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ANO7Q6IWH7 933 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM83AQ86UY5 434 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 TRABD2AQ86V40 505 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SPARTQ8N0X7 666 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 LINS1Q8NG48 757 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SUN3Q8TAQ9 357 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 APOPT1Q96IL0 206 aa6.14□□□□□ -1.43
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