RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 TWNKQ96RR1 684 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SMOQ99835 787 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 KRT82Q9NSB4 513 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GMIPQ9P107 970 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 INVSQ9Y283 1065 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CPQQ9Y646 472 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MYO1FO00160 1098 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 COMTP21964 271 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 YWHAQP27348 245 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ASPAP45381 313 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SLC6A11P48066 632 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 DR1Q01658 176 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 KDSRQ06136 332 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SPEM2Q0P670 501 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PTP4A2Q12974 167 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MESDQ14696 234 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PDGFRLQ15198 375 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CYP1B1Q16678 543 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ZNF394Q53GI3 561 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CEP68Q76N32 757 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 TTC30AQ86WT1 665 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 FUKQ8N0W3 1084 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 IQCKQ8N0W5 287 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 NUP93Q8N1F7 819 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CD101Q93033 1021 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MSANTD3Q96H12 275 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 POM121Q96HA1 1249 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 USP18Q9UMW8 372 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CEP83Q9Y592 693 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 NDC80O14777 642 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MDM4O15151 490 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 COCHO43405 550 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PSTPIP1O43586 416 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 TBX18O95935 607 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ADH1CP00326 375 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CYP17A1P05093 508 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CALB1P05937 261 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GNA15P30679 374 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PEX5P50542 639 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SLC5A3P53794 718 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 NRLP54845 237 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MESP2Q0VG99 397 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PPP2R5DQ14738 602 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 C2orf27AQ580R0 203 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 EMC10Q5UCC4 262 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms