RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		15.28	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	LAMA1	P25391	3075 aa		15.28	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GTH6	734 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	SRGAP2	O75044	1071 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	ASL	P04424	464 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CALB1	P05937	261 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	KRT3	P12035	628 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	NNMT	P40261	264 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PTGER3	P43115	390 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CXCR3	P49682	368 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	UBASH3A	P57075	661 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGAP8	P85298	464 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	C14orf80	Q86SX3	495 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	APCDD1	Q8J025	514 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	MUC3B	Q9H195	1237 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	MTG2	Q9H4K7	406 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CD248	Q9HCU0	757 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	VPS45	Q9NRW7	570 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MEI4	A8MW99	385 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	GDF9	O60383	454 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CFI	P05156	583 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	IRAK1	P51617	712 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ECT2L	Q008S8	904 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PTPRN	Q16849	979 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ACCSL	Q4AC99	568 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TRNP1	Q6NT89	227 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T3	Q8NH03	318 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SUN2	Q9UH99	717 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	VPS28	Q9UK41	221 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PQC6	194 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	BNIP3L	O60238	219 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DNTT	P04053	509 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RHOC	P08134	193 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF806	P0C7X5	589 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DES	P17661	470 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	GPD1	P21695	349 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CD6	P30203	668 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	OXCT1	P55809	520 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ENPP2	Q13822	863 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SNX19	Q92543	992 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	BAP1	Q92560	729 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MCEE	Q96PE7	176 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	GPR174	Q9BXC1	333 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM245	Q9H330	911 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	IFNK	Q9P0W0	207 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TTC34	A8MYJ7	566 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PATE3	B3GLJ2	98 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880		E9PAM4	449 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN11	O75508	207 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CNTN5	O94779	1100 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SKIL	P12757	684 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SDHB	P21912	280 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ITPKA	P23677	461 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TPMT	P51580	245 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	COPA	P53621	1224 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF33A	Q06730	810 aa		15.24	■□□□□ 0.03

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