RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	HOXA6	P31267	233 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ADRA1B	P35368	520 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	IRAK1	P51617	712 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ZNF75D	P51815	510 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ZNF234	Q14588	700 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	RNF43	Q68DV7	783 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	HMGB4	Q8WW32	186 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	C1orf74	Q96LT6	269 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	RAD54B	Q9Y620	910 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902		E9PAM4	449 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	NPC1	O15118	1278 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	AKR1B10	O60218	316 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	LILRB5	O75023	590 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CSK	P41240	450 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	IL12RB1	P42701	662 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	OGDH	Q02218	1023 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	STARD3	Q14849	445 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	FUT11	Q495W5	492 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CEP68	Q76N32	757 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CCDC185	Q8N715	623 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	THAP2	Q9H0W7	228 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		18.29	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CLDN11	O75508	207 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	RNF8	O76064	485 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CNTN5	O94779	1100 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CDH4	P55283	916 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	OXCT1	P55809	520 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ST8SIA6	P61647	398 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CCDC42	Q96M95	316 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CHP1	Q99653	195 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	GABRG3	Q99928	467 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TRIM7	Q9C029	511 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	MPP6	Q9NZW5	540 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	EBF1	Q9UH73	591 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	RAB23	Q9ULC3	237 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	INVS	Q9Y283	1065 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	FRYL	O94915	3013 aa		18.28	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	HR	O43593	1189 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	EPHX1	P07099	455 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CNR2	P34972	360 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SLC12A1	Q13621	1099 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SLC18A3	Q16572	532 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	LPAL2	Q16609	132 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ALF	Q53S48	1182 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	EFHC2	Q5JST6	749 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	APCDD1	Q8J025	514 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	LMLN	Q96KR4	655 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	MUC3B	Q9H195	1237 aa		18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CKAP5	Q14008	2032 aa		18.27	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		18.27	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	THADA	Q6YHU6	1953 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PQF6	199 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	DRGX	A6NNA5	263 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ASL	P04424	464 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	RHOC	P08134	193 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	HLA-E	P13747	358 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PRKCH	P24723	683 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	OR1E1	P30953	314 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	GALC	P54803	685 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ARID5B	Q14865	1188 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	C5orf22	Q49AR2	442 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		18.26	■□□□□ 0.51

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