RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 AIF1P55008 147 aa18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 TPI1P60174 286 aa18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 UBXN11Q5T124 520 aa18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 ANO7Q6IWH7 933 aa18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 HFE2Q6ZVN8 426 aa18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 TP53INP2Q8IXH6 220 aa18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 ADAM32Q8TC27 787 aa18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF778Q96MU6 729 aa18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 SLC9A7Q96T83 725 aa18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM216Q9P0N5 145 aa18.77■□□□□ 0.6
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SYNE4-204ENST00000465425 SOX13Q9UN79 622 aa18.77■□□□□ 0.6
SYNE4-204ENST00000465425 PLA2G4CQ9UP65 541 aa18.77■□□□□ 0.6
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SYNE4-204ENST00000465425 SPRP35270 261 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 OLIG2Q13516 323 aa18.77■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC153Q494R4 210 aa18.77■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 NRG4Q8WWG1 115 aa18.77■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 MS4A4AQ96JQ5 239 aa18.77■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 TREHO43280 583 aa18.76■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 FBXO21O94952 628 aa18.76■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 AP2A1O95782 977 aa18.76■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 FAM72AQ5TYM5 149 aa18.76■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 C1orf146Q5VVC0 180 aa18.76■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 FAM72DQ6L9T8 149 aa18.76■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 SERPINB8P50452 374 aa18.75■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ARL13BQ3SXY8 428 aa18.75■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 CMC1Q7Z7K0 106 aa18.75■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ITGA9Q13797 1035 aa18.75■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 NTAN1Q96AB6 310 aa18.75■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 SLC7A8Q9UHI5 535 aa18.75■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ADAM28Q9UKQ2 775 aa18.75■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 AP2B1P63010 937 aa18.74■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 ZFP42Q96MM3 310 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 PANX3Q96QZ0 392 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 PNPOQ9NVS9 261 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJC28Q9NX36 388 aa18.74■□□□□ 0.59
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SYNE4-204ENST00000465425 SIN3BO75182 1162 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 AP1G2O75843 785 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 USP1O94782 785 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 COPAP53621 1224 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 LIMK2P53671 638 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ACTR3P61158 418 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 FSTL4Q6MZW2 842 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 SORT1Q99523 831 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF358Q9NW07 568 aa18.74■□□□□ 0.59
SYNE4-204ENST00000465425 DDIT4Q9NX09 232 aa18.74■□□□□ 0.59
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