RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 CALB1P05937 261 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PDGFRAP16234 1089 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 SDHBP21912 280 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PTGER3P43115 390 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 COPAP53621 1224 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ATP11AP98196 1134 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PTP4A2Q12974 167 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 SLC12A1Q13621 1099 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CACUL1Q86Y37 369 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 APCDD1Q8J025 514 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 DEFB119Q8N690 84 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 OR2T3Q8NH03 318 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PIGKQ92643 395 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CD93Q9NPY3 652 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 SUN2Q9UH99 717 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 I6L893 689 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 GJB6O95452 261 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 KRT3P12035 628 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 TNFAIP3P21580 790 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 SDC4P31431 198 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 IRAK1P51617 712 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 OXCT1P55809 520 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 FANCCQ00597 558 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 FAM131BQ86XD5 332 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PRSS16Q9NQE7 514 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ITM2CQ9NQX7 267 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ERVW-1Q9UQF0 538 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 SNX10Q9Y5X0 201 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 NUP205Q92621 2012 aa24.71■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 GDF9O60383 454 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 NDUFS2O75306 463 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 CLDN11O75508 207 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 ACADMP11310 421 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 ECT2LQ008S8 904 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 ASIC2Q16515 512 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 CDO1Q16878 200 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 C5orf22Q49AR2 442 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 LYSMD4Q5XG99 296 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC31Q6UY01 552 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 MON1BQ7L1V2 547 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 BNIPLQ7Z465 357 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 MYO19Q96H55 970 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 MRGPRX3Q96LB0 322 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 FBRSQ9HAH7 460 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 DLL3Q9NYJ7 618 aa24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 ENDOD1O94919 500 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 CD6P30203 668 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 NUMBP49757 651 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 CDH4P55283 916 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC14Q49A88 953 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 TCEAL6Q6IPX3 200 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 KDM1BQ8NB78 822 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 C3orf20Q8ND61 904 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 NETO1Q8TDF5 533 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 TCEAL3Q969E4 200 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf74Q96LT6 269 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 MTG2Q9H4K7 406 aa24.69■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 CNTN5O94779 1100 aa24.68■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 TPMTP51580 245 aa24.68■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 PLK1P53350 603 aa24.68■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 UBASH3AP57075 661 aa24.68■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF33AQ06730 810 aa24.68■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 ACAD10Q6JQN1 1059 aa24.68■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.68■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 HAPLN3Q96S86 360 aa24.68■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 ITPKAP23677 461 aa24.67■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 OXTRP30559 389 aa24.67■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 PTPN9P43378 593 aa24.67■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 SULT2A1Q06520 285 aa24.67■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 RAB6CQ53S08 254 aa24.67■■□□□ 1.54
SMKR1-201ENST00000462322 ALFQ53S48 1182 aa24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms