RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428941.5

STAG2-208, Transcript of stromal antigen 2, human

TSL 3

Gene STAG2, Length 678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAG2-208	ENST00000428941	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941		A0A087WV62	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	FFAR2	O15552	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CYP3A4	P08684	503 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CCKAR	P32238	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	POLD2	P49005	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	BTK	Q06187	659 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	GALNT3	Q14435	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	NEURL1	O76050	574 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CYP3A7	P24462	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	MARK4	Q96L34	752 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	PMPCA	Q10713	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	LPAR1	Q92633	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	PLIN1	O60240	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	ARRB2	P32121	409 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CCKBR	P32239	447 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	RCAN1	P53805	252 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	ADPRH	P54922	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	MDM4	O15151	490 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	LARGE1	O95461	756 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	CYP21A2	P08686	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STAG2-208	ENST00000428941	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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