RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 DMDP11532 3685 aa22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-20-201ENST00000390606 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-20-201ENST00000390606 CNTN5O94779 1100 aa22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARID5BQ14865 1188 aa22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 LPAL2Q16609 132 aa22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLEKHG6Q3KR16 790 aa22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 CEP68Q76N32 757 aa22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALG14Q96F25 216 aa22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYO19Q96H55 970 aa22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 CNPY3Q9BT09 278 aa22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBSNQ9H1K0 784 aa22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A087X0T9 212 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 E9PAM4 449 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 DCLK1O15075 740 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 CLDN11O75508 207 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM228BP0C875 321 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 HLA-EP13747 358 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLK1P53350 603 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDH4P55283 916 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC12A1Q13621 1099 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 KBTBD6Q86V97 674 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 DRC7Q8IY82 874 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC185Q8N715 623 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 NTAN1Q96AB6 310 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 MRGPRX3Q96LB0 322 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAJC7Q99615 494 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLA2G4CQ9UP65 541 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 INVSQ9Y283 1065 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 CKAP5Q14008 2032 aa22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANKRD62A6NC57 917 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ASLP04424 464 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 NDUFV2P19404 249 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 P2RY2P41231 377 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 STARD3Q14849 445 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLK5Q496M5 336 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 MANEALQ5VSG8 457 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRRC31Q6UY01 552 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 VPS36Q86VN1 386 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 RLN3Q8WXF3 142 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 RUBCNQ92622 972 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF653Q96CK0 615 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 MRGPRX1Q96LB2 322 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 MPP6Q9NZW5 540 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAB23Q9ULC3 237 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 NENFQ9UMX5 172 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 MOCS3O95396 460 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 EPHX1P07099 455 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYBL1P10243 752 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 OXCT1P55809 520 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCAPQ12770 1279 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 PGBD3Q8N328 593 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF366Q8N895 744 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM11Q96F44 468 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM7Q9C029 511 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 ERVW-1Q9UQF0 538 aa22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 SRGAP2O75044 1071 aa22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 BCKDHBP21953 392 aa22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 COPAP53621 1224 aa22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMC6Q7Z403 805 aa22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 DCLK2Q8N568 766 aa22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 FRMD1Q8N878 549 aa22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 FEM1AQ9BSK4 669 aa22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM5Q9C035 493 aa22.66■■□□□ 1.22
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