RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 FMO2Q99518 471 aa25.23■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 ECHS1P30084 290 aa25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 VPS41P49754 854 aa25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 RGS19P49795 217 aa25.23■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 C5orf60A6NFR6 353 aa25.22■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 PLTPP55058 493 aa25.22■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 KCNC3Q14003 757 aa25.22■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 CEP128Q6ZU80 1094 aa25.22■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 ATPAF2Q8N5M1 289 aa25.22■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC46A2Q9BY10 475 aa25.22■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 KLC2Q9H0B6 622 aa25.22■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa25.22■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 Q6ZNB5 142 aa25.21■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.21■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 GLIS1Q8NBF1 620 aa25.21■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 VAT1Q99536 393 aa25.21■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 LGMNQ99538 433 aa25.21■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 PRO3102Q9H379 93 aa25.21■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 C10orf88Q9H8K7 445 aa25.21■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 GJA1P17302 382 aa25.2■■□□□ 1.62
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ECHDC3-201ENST00000379215 ZDHHC24Q6UX98 284 aa25.2■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa25.2■■□□□ 1.62
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ECHDC3-201ENST00000379215 CHD9Q3L8U1 2897 aa25.2■■□□□ 1.62
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ECHDC3-201ENST00000379215 A0A1W2PPC1 479 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 OPHN1O60890 802 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 MOSPD3O75425 235 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 CLDN11O75508 207 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ETS1P14921 441 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC6A4P31645 630 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ITGA8P53708 1063 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 PARP15Q460N3 678 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 HOOK3Q86VS8 718 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM217AQ8IXS0 508 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC13Q8IYE1 715 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 FBXO25Q8TCJ0 367 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 TCEAL4Q96EI5 215 aa25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 P2RY11Q96G91 374 aa25.19■■□□□ 1.62
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ECHDC3-201ENST00000379215 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
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ECHDC3-201ENST00000379215 VAV1P15498 845 aa25.19■■□□□ 1.62
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ECHDC3-201ENST00000379215 ALFQ53S48 1182 aa25.19■■□□□ 1.62
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ECHDC3-201ENST00000379215 A0A1B0GVM2 712 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 E2F8A0AVK6 867 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 TCAF2A6NFQ2 919 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ATP8B1O43520 1251 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 GREM1O60565 184 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 RAMP2O60895 175 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 OR1E1P30953 314 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 CHKAP35790 457 aa25.18■■□□□ 1.62
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