RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 SCML1Q9UN30 329 aa13.9□□□□□ -0.18
TTPAL-203ENST00000372906 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
TTPAL-203ENST00000372906 LRRC72A6NJI9 287 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TLR4O00206 839 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 C1SP09871 688 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 VDRP11473 427 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 VAV1P15498 845 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 HNF1BP35680 557 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 SYKP43405 635 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 PSMD8P48556 350 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 ADPRHP54922 357 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TBX4P57082 545 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 RTP5Q14D33 572 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 PITRM1Q5JRX3 1037 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 UNC45BQ8IWX7 931 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 APCDD1Q8J025 514 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 SCML4Q8N228 414 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 OR14C36Q8NHC7 312 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 PTPRN2Q92932 1015 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 COL26A1Q96A83 441 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 CAAP1Q9H8G2 361 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 GDF3Q9NR23 364 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 COQ4Q9Y3A0 265 aa13.89□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TENM4Q6N022 2769 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 IRAK2O43187 625 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 LTFP02788 710 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 ASLP04424 464 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 SETSIPP0DME0 302 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 GOT1P17174 413 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 STK19P49842 368 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 CCR5P51681 352 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 NXPH1P58417 271 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 ARID5BQ14865 1188 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 EDRF1Q3B7T1 1238 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 DCAF6Q58WW2 860 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 MS4A13Q5J8X5 152 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TCERG1LQ5VWI1 586 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 NUGGCQ68CJ6 796 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 PCSK4Q6UW60 755 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 AZIN2Q96A70 460 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 SKA1Q96BD8 255 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 NRSN2Q9GZP1 204 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 MIS12Q9H081 205 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 FZD4Q9ULV1 537 aa13.88□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TBC1D3EA0A087X179 549 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TBC1D3LB9A6J9 549 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TK2O00142 265 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 CETN3O15182 167 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 BRINP1O60477 761 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 SDC3O75056 442 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TBC1D3HP0C7X1 549 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 EPB41P11171 864 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 BRD2P25440 801 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 DRD3P35462 400 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 RXRGP48443 463 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 ECT2LQ008S8 904 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC173Q0VFZ6 552 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 CDH18Q13634 790 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 SFMBT2Q5VUG0 894 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF843Q8N446 348 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 KAT5Q92993 513 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 CA5BQ9Y2D0 317 aa13.87□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa13.86□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa13.86□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 TRIM38O00635 465 aa13.86□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 RRP8O43159 456 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 STX10O60499 249 aa13.86□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 RTN2O75298 545 aa13.86□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 IL1BP01584 269 aa13.86□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
TTPAL-203ENST00000372906 CDK4P11802 303 aa13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms