RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 METTL6Q8TCB7 284 aa22.8■■□□□ 1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 RARAP10276 462 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DLG4P78352 724 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 CBWD6Q4V339 395 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 OR56A4Q8NGH8 313 aa22.8■■□□□ 1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.78■■□□□ 1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 PAEPP09466 180 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ETS1P14921 441 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 CRY1Q16526 586 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.77■■□□□ 1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 MYPNQ86TC9 1320 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 F8VP50 259 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB14O43829 449 aa22.77■■□□□ 1.24
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