RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325974.8

CCZ1-201, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCZ1, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-201ENST00000325974 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CCZ1-201ENST00000325974 PSMB4P28070 264 aa28.71■■■□□ 2.19
CCZ1-201ENST00000325974 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CCZ1-201ENST00000325974 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.19
CCZ1-201ENST00000325974 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa28.71■■■□□ 2.19
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF683Q8IZ20 524 aa28.71■■■□□ 2.19
CCZ1-201ENST00000325974 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP28.71■■■□□ 2.19
CCZ1-201ENST00000325974 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CCZ1-201ENST00000325974 VAT1Q99536 393 aa28.71■■■□□ 2.19
CCZ1-201ENST00000325974 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CCZ1-201ENST00000325974 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa28.71■■■□□ 2.19
CCZ1-201ENST00000325974 FGBP02675 491 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ALDH1A3P47895 512 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 SARNPP82979 210 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 TDRPQ86YL5 185 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 GPR65Q8IYL9 337 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 LRRC39Q96DD0 335 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 TSGA13Q96PP4 275 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 RABGEF1Q9UJ41 708 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 TRHDEQ9UKU6 1024 aa28.7■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 GCAP28676 217 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 TADA2BQ86TJ2 420 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 AUTS2Q8WXX7 1259 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 DPF3Q92784 378 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 MYRFLQ96LU7 910 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 MPP6Q9NZW5 540 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 FNIP2Q9P278 1114 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 VANGL2Q9ULK5 521 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ALPK3Q96L96 1907 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 F5H423 210 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 DFFAO00273 331 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 GJB5O95377 273 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 HMBSP08397 361 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 DNAJB2P25686 324 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 GNGT1P63211 74 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 MTA1Q13330 715 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 TEX44Q53QW1 395 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 LRRC31Q6UY01 552 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 FETUBQ9UGM5 382 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 DNMT3LQ9UJW3 386 aa28.69■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF840PA6NDX5 716 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 SPAG6O75602 509 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 CCNCP24863 283 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 MDH1P40925 334 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ZBTB17Q13105 803 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 AFMIDQ63HM1 303 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 TAOK1Q7L7X3 1001 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 EXOC3L1Q86VI1 746 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 NLRP14Q86W24 1093 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 FBF1Q8TES7 1133 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 SLC39A8Q9C0K1 460 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ACSS3Q9H6R3 686 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 NDFIP2Q9NV92 336 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 STK39Q9UEW8 545 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 SLC24A2Q9UI40 661 aa28.68■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa28.67■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 MLNP12872 115 aa28.67■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 MMP13P45452 471 aa28.67■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 IRAK1P51617 712 aa28.67■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 FIBCD1Q8N539 461 aa28.67■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ATPAF2Q8N5M1 289 aa28.67■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ZYG11BQ9C0D3 744 aa28.67■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 FGF18O76093 207 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 RHOQP17081 205 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ELF1P32519 619 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 GRIA1P42261 906 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 GUCY1A3Q02108 690 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 FPGSQ05932 587 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 RASA2Q15283 850 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 NUGGCQ68CJ6 796 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 KLHDC10Q6PID8 442 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 CYP4X1Q8N118 509 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 BADQ92934 168 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 SIGLEC10Q96LC7 697 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 TBK1Q9UHD2 729 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 MAFFQ9ULX9 164 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 PRRG1O14668 218 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 LILRB3O75022 631 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 LINC00271P0C7V0 271 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 EN2P19622 333 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 VEPH1Q14D04 833 aa28.66■■■□□ 2.18
CCZ1-201ENST00000325974 KLHL38Q2WGJ6 581 aa28.66■■■□□ 2.18
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