RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324727.8

SCN4B-201, Transcript of sodium voltage-gated channel beta subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCN4B, Length 4,484 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4B-201ENST00000324727 NR1D2Q14995 579 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 SLC35G1Q2M3R5 365 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 CCDC157Q569K6 752 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 EPS8L1Q8TE68 723 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 VPS50Q96JG6 964 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 PREBQ9HCU5 417 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 NT5MQ9NPB1 228 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 PHLPP1O60346 1717 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 LTN1O94822 1766 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 SAC3D1A6NKF1 404 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 E9PBE3 544 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 MATN2O00339 956 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 HOXA2O43364 376 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 KLHL41O60662 606 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF23P17027 643 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 CRHR2Q13324 411 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 MYBPC2Q14324 1141 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 PERM1Q5SV97 790 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 DEPDC1Q5TB30 811 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 ZFP1Q6P2D0 407 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 RNF148Q8N7C7 305 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 NAT14Q8WUY8 206 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 CEP44Q9C0F1 390 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SCN4B-201ENST00000324727 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 CLOCKO15516 846 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 RGS5O15539 181 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 RARAP10276 462 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 PBX1P40424 430 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 CDK7P50613 346 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 FKBP1BP68106 108 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 HTRA3P83110 453 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 IKBKEQ14164 716 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 LPIN1Q14693 890 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 KCNA10Q16322 511 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 IMPG1Q17R60 797 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 KYQ8NBH2 561 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 STMN3Q9NZ72 180 aa11.9□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 KCNA2P16389 499 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 TTKP33981 857 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 GCNT1Q02742 428 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 SGO1Q5FBB7 561 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 TPGS1Q6ZTW0 290 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 ZBTB46Q86UZ6 589 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 RUBCNLQ9H714 662 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 CERS4Q9HA82 394 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 VANGL2Q9ULK5 521 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 CCNFP41002 786 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 NPY5RQ15761 445 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 CES3Q6UWW8 571 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 TASP1Q9H6P5 420 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 PIAS1O75925 651 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 OR4Q2P0C623 313 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 SMPD1P17405 629 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 JAK1P23458 1154 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 MIPP30301 263 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 GRIK3Q13003 919 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 PLD1Q13393 1074 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 TCEA2Q15560 299 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 MIIPQ5JXC2 388 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 C1orf50Q9BV19 199 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 RAD21L1Q9H4I0 556 aa11.89□□□□□ -0.51
SCN4B-201ENST00000324727 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms