RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 NNTQ13423 1086 aa16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 EML3Q32P44 896 aa16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 NT5DC3Q86UY8 548 aa16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 RHOT1Q8IXI2 618 aa16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 ADAM32Q8TC27 787 aa16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 SH3RF2Q8TEC5 729 aa16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 CYP2S1Q96SQ9 504 aa16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 MARCH2Q9P0N8 246 aa16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 COX16Q9P0S2 106 aa16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 NUDT5Q9UKK9 219 aa16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 CCDC66A2RUB6 948 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 C4orf47A7E2U8 309 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 COCHO43405 550 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 PSTPIP1O43586 416 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 IGLV3-25P01717 112 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 TCF3P15923 654 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 HDAC4P56524 1084 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 LRRC38Q5VT99 294 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 SCYL2Q6P3W7 929 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 BNIPLQ7Z465 357 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 UBL4BQ8N7F7 174 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 RNF34Q969K3 372 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 SLC22A12Q96S37 553 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 USP24Q9UPU5 2620 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 HYOU1Q9Y4L1 999 aa16.49■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 NUP205Q92621 2012 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 SLC12A8A0AV02 714 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 CTAGE9A4FU28 777 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 C2orf78A6NCI8 922 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 TBX18O95935 607 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 PROS1P07225 676 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 KRT7P08729 469 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 SLC2A3P11169 496 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 TNNT1P13805 278 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 HDCP19113 662 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 CTNNA2P26232 953 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 MIPP30301 263 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 CASQ1P31415 396 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 GJC1P36383 396 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 TBX4P57082 545 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 RPS6KA1Q15418 735 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 ARL13BQ3SXY8 428 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 PMS2CLQ68D20 193 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 POLNQ7Z5Q5 900 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 FAM131BQ86XD5 332 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 MIB1Q86YT6 1006 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 WDR24Q96S15 920 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 TPSD1Q9BZJ3 242 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 PIGVQ9NUD9 493 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 DNAI1Q9UI46 699 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 TLR6Q9Y2C9 796 aa16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 HELZP42694 1942 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 LNP1A1A4G5 178 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 MDM4O15151 490 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 OLFM2O95897 454 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 APOEP02649 317 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 CXCR3P49682 368 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 AIF1P55008 147 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 TAS2R40P59535 323 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 COG7P83436 770 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 RING1Q06587 406 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 MTA1Q13330 715 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 CYP2U1Q7Z449 544 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 USP33Q8TEY7 942 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 NTAN1Q96AB6 310 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 PLD4Q96BZ4 506 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 LINC00597Q9H2U6 94 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 WDCPQ9H6R7 721 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 ZWILCHQ9H900 591 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 TMEM9BQ9NQ34 198 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 PCSK1NQ9UHG2 260 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 INVSQ9Y283 1065 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 THADAQ6YHU6 1953 aa16.47■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 CCR1P32246 355 aa16.46■□□□□ 0.23
IFT20-201ENST00000322326 SEC13P55735 322 aa16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms