RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 IDH3AP50213 366 aa21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2-201ENST00000308020 DCAF6Q58WW2 860 aa21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2-201ENST00000308020 CMC1Q7Z7K0 106 aa21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2-201ENST00000308020 TLK2Q86UE8 772 aa21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2-201ENST00000308020 NME8Q8N427 588 aa21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2-201ENST00000308020 PPP4R1Q8TF05 950 aa21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2-201ENST00000308020 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa21.52■■□□□ 1.04
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PTDSS2-201ENST00000308020 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2-201ENST00000308020 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.52■■□□□ 1.04
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PTDSS2-201ENST00000308020 YY1P25490 414 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 EP400NLQ6ZTU2 488 aa21.51■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 PIGZQ86VD9 579 aa21.51■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 RNF139Q8WU17 664 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF560Q96MR9 790 aa21.51■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 COPG2Q9UBF2 871 aa21.51■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.51■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 KLHL2O95198 593 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF567Q8N184 647 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 SCNN1AP37088 669 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 COPAP53621 1224 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 LILRA4P59901 499 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 BEX3Q00994 111 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 ITGA9Q13797 1035 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 UBXN11Q5T124 520 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 TNS4Q8IZW8 715 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 ASB3Q9Y575 518 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 USP12O75317 370 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 BEST1O76090 585 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 PYDC1Q8WXC3 89 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 32.7
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PTDSS2-201ENST00000308020 TSC22D3Q99576 134 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 PIDD1Q9HB75 910 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 GPAMQ9HCL2 828 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 IPPQ9Y573 584 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 MAGEA13PA6NCF6 341 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 PDE5AO76074 875 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 CERS2Q96G23 380 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 TNIP3Q96KP6 325 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 AXLP30530 894 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 GP5P40197 560 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 GLUD2P49448 558 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 NDUFV1P49821 464 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 PEX6Q13608 980 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 PDPK2PQ6A1A2 396 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2-201ENST00000308020 PID1Q7Z2X4 250 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTDSS2-201ENST00000308020 OR52K1Q8NGK4 314 aa21.49■■□□□ 1.03
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