RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 HINFPQ9BQA5 517 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 CEP41Q9BYV8 373 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ECT2Q9H8V3 914 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 SNX12Q9UMY4 172 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ANHXE9PGG2 379 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ARNTLO00327 626 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 MFSD11O43934 449 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 BMP1P13497 986 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 HLA-FP30511 346 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 CD70P32970 193 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ACVRL1P37023 503 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ARL4AP40617 200 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 IFNAR2P48551 515 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 MANEALQ5VSG8 457 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ZNF354CQ86Y25 554 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ELSPBP1Q96BH3 223 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 KLC2Q9H0B6 622 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 F5H423 210 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 H0Y626 953 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 CTNNA2P26232 953 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 KDSRQ06136 332 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 SNX1Q13596 522 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 CDH18Q13634 790 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 DPYSQ14117 519 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 LINGO4Q6UY18 593 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 MFN1Q8IWA4 741 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 OR7D4Q8NG98 312 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 TEKT4Q8WW24 435 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 TSC1Q92574 1164 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ASB2Q96Q27 587 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 LGMNQ99538 433 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 EPAS1Q99814 870 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ABCB8Q9NUT2 735 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 MUTYHQ9UIF7 546 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 DFFAO00273 331 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 CHKAP35790 457 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 TERF1P54274 439 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 AMPD2Q01433 879 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 GAB4Q2WGN9 574 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 LRRC38Q5VT99 294 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 LRRC31Q6UY01 552 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 APCDD1Q8J025 514 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ZNF366Q8N895 744 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 EXD1Q8NHP7 514 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D31Q96DN5 1066 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 RNF157Q96PX1 679 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 STOML2Q9UJZ1 356 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 SAR1BQ9Y6B6 198 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 GON4LQ3T8J9 2241 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 SNAP91O60641 907 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ADH5P11766 374 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 GJA4P35212 333 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 RUNX3Q13761 415 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 GEN1Q17RS7 908 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 CCDC181Q5TID7 509 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 TMEM215Q68D42 235 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 NLRP14Q86W24 1093 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ADHFE1Q8IWW8 467 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 C1orf74Q96LT6 269 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 SPON2Q9BUD6 331 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 CA14Q9ULX7 337 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 LOC730098B7Z3J9 87 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 GFRA2O00451 464 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 DCLK1O15075 740 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 TULP3O75386 442 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 ECI2O75521 394 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 GJB3O75712 270 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 HOXC13P31276 330 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 CSKP41240 450 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPA-201ENST00000260116 KCNJ1P48048 391 aa11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms