RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258499.7

USP44-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP44, Length 4,022 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44-201ENST00000258499 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 NRF1Q16656 503 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ILDR2Q71H61 639 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 KCNMB4Q86W47 210 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 RIOX2Q8IUF8 465 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ADGRF2Q8IZF7 708 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PHTF2Q8N3S3 785 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ZNF781Q8N8C0 355 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 KYQ8NBH2 561 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 MTMR14Q8NCE2 650 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PHF21BQ96EK2 531 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 AGAP2Q99490 1192 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 FZD8Q9H461 694 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PDZD7Q9H5P4 517 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CAAP1Q9H8G2 361 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 KCNK13Q9HB14 408 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 COPG2Q9UBF2 871 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 NUMBLQ9Y6R0 609 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 M0QZ92 97 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SLC25A27O95847 323 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 AMHP03971 560 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 C2P06681 752 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CTSHP09668 335 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 FAM200BP0CF97 657 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 LMO2P25791 158 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PMLP29590 882 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ICAM3P32942 547 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ETV4P43268 484 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ACADSBP45954 432 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TAF6P49848 677 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SLC26A2P50443 739 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 AQP4P55087 323 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ENPEPQ07075 957 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 LAMC2Q13753 1193 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PDK3Q15120 406 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ZNF484Q5JVG2 852 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 NOTUMQ6P988 496 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 C16orf89Q6UX73 402 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CYP2R1Q6VVX0 501 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SCN4BQ8IWT1 228 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 FAM156AQ8NDB6 213 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SLC10A4Q96EP9 437 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 VPS39Q96JC1 886 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 S100A14Q9HCY8 104 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 KRT82Q9NSB4 513 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CDH22Q9UJ99 828 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 V9GYQ6 96 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TK2O00142 265 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 BIRC5O15392 142 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 AKAP10O43572 662 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 MYL3P08590 195 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ERCC2P18074 760 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TSPAN8P19075 237 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 IDH3AP50213 366 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CTBP1Q13363 440 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 LAMB3Q13751 1172 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PTK2BQ14289 1009 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CSHL1Q14406 222 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 LBRQ14739 615 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 GRIK4Q16099 956 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 KYAT1Q16773 422 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TMEM198Q66K66 360 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TMC7Q7Z402 723 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SNX31Q8N9S9 440 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 URGCPQ8TCY9 931 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 JADE3Q92613 823 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 RCN3Q96D15 328 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SIGLEC10Q96LC7 697 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 WDCPQ9H6R7 721 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CHRAC1Q9NRG0 131 aa4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CCDC167Q9P0B6 97 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms