RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP9Q7RTR0 991 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 OTOAQ7RTW8 1153 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBED8Q8IZ13 594 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 KIRREL3Q8IZU9 778 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP11CQ8NB49 1132 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa27.1■■□□□ 1.93
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CAPNS1-201ENST00000246533 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOVL4Q9GZR5 314 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM30AQ9NV96 361 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa27.1■■□□□ 1.93
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CAPNS1-201ENST00000246533 YIPF1Q9Y548 306 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC22O60826 627 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 INCA1Q0VD86 236 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
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CAPNS1-201ENST00000246533 LVRNQ6Q4G3 990 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM163BP0C2L3 166 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP8P22894 467 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNA2D1P54289 1103 aa27.08■■□□□ 1.93
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CAPNS1-201ENST00000246533 STOML1Q9UBI4 398 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 DPP7Q9UHL4 492 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 GRID1Q9ULK0 1009 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ATF6P18850 670 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL4CP56559 192 aa27.08■■□□□ 1.93
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CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf33Q8N1A6 199 aa27.08■■□□□ 1.93
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CAPNS1-201ENST00000246533 CYP3A43Q9HB55 503 aa27.08■■□□□ 1.93
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CAPNS1-201ENST00000246533 PPIL6Q8IXY8 311 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
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CAPNS1-201ENST00000246533 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHB2P29323 1055 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 GJC1P36383 396 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYBG2Q8N1P7 616 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35B2Q8TB61 432 aa27.05■■□□□ 1.92
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