RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 H0Y626 953 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 NRLP54845 237 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CDH18Q13634 790 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 ZNF234Q14588 700 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 RASSF3Q86WH2 238 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CHPFQ8IZ52 775 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 APCDD1Q8J025 514 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 MYO19Q96H55 970 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CIPCQ9C0C6 399 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 MPP6Q9NZW5 540 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 EBF1Q9UH73 591 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 PROB1E7EW31 1015 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 PSMA2P25787 234 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 DGKEP52429 567 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 PLK1P53350 603 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CDH4P55283 916 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 LONP2Q86WA8 852 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 PYROXD2Q8N2H3 581 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 TMEM245Q9H330 911 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 OR12D3Q9UGF7 316 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 FZD10Q9ULW2 581 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 HRO43593 1189 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SRGAP2O75044 1071 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 CLDN11O75508 207 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 APBB3O95704 486 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 CSKP41240 450 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHG6Q3KR16 790 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 UCMAQ8WVF2 138 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 MRGPRX3Q96LB0 322 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 PEBP4Q96S96 227 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 RAD54BQ9Y620 910 aa22.95■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 NPC1O15118 1278 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 DLDP09622 509 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 HOXB2P14652 356 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 PRKCHP24723 683 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 TSTD1Q8NFU3 115 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 BTBD6Q96KE9 485 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 CCDC42Q96M95 316 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 NUP85Q9BW27 656 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 CKAP5Q14008 2032 aa22.94■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 AKR1B10O60218 316 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 LRCH4O75427 683 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 LRIG2O94898 1065 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 FECHP22830 423 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 NUMBP49757 651 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SEMA3BQ13214 749 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SLC12A1Q13621 1099 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 LRRC31Q6UY01 552 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 NLRP14Q86W24 1093 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ERLEC1Q96DZ1 483 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 FEM1AQ9BSK4 669 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 DEF6Q9H4E7 631 aa22.93■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 TCF4P15884 667 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 MIPP30301 263 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 L1CAMP32004 1257 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G5P39877 138 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 CA9Q16790 459 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SDE2Q6IQ49 451 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ANO7Q6IWH7 933 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 CHD5Q8TDI0 1954 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 GPR179Q6PRD1 2367 aa22.92■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 AXIN1O15169 862 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 H2AFZP0C0S5 128 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 HLA-EP13747 358 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 GABRG2P18507 467 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms