RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 PGAM1P18669 254 aa27.71■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 HARS2P49590 506 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 XIAPP98170 497 aa27.71■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 FAM81AQ8TBF8 368 aa27.71■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 HIC2Q96JB3 615 aa27.71■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC160A6NGH7 325 aa27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 DGKIO75912 1065 aa27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 HSPA4LO95757 839 aa27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 ATP6V1B1P15313 513 aa27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 TBC1D25Q3MII6 688 aa27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 PAOXQ6QHF9 649 aa27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 HACE1Q8IYU2 909 aa27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 PQLC1Q8N2U9 271 aa27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 SNX15Q9NRS6 342 aa27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 APPL1Q9UKG1 709 aa27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 AKT3Q9Y243 479 aa27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa27.7■■■□□ 2.03
FAM149A-201ENST00000227065 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 DLG2Q15700 870 aa27.7■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 ADAM32Q8TC27 787 aa27.7■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 NFKBIEO00221 500 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 RNF103O00237 685 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 CREB3O43889 395 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 PTPN9P43378 593 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 INHBCP55103 352 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 DPEP3Q9H4B8 488 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 CAB39LQ9H9S4 337 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 MYL4P12829 197 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 INSRRP14616 1297 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 PSMB4P28070 264 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 FAM187BQ17R55 369 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 SH3D19Q5HYK7 790 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 KCNK16Q96T55 309 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 NFKBIZQ9BYH8 718 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 MFSD11O43934 449 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 DNAJA2O60884 412 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 TOMM70O94826 608 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 TFAP2AP05549 437 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 IRF9Q00978 393 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 CNGA3Q16281 694 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 FAM131BQ86XD5 332 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 DCLK2Q8N568 766 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 TTC39CQ8N584 583 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 CNBD2Q96M20 576 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa27.69■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 AMHP03971 560 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 MX2P20592 715 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 SCN1AP35498 2009 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 EPGNQ6UW88 154 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 METTL25Q8N6Q8 603 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 OR6B3Q8NGW1 331 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 P2RY11Q96G91 374 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 BTBD9Q96Q07 612 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 CDH19Q9H159 772 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 FAM96AQ9H5X1 160 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 RNF19AQ9NV58 838 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 VILLO15195 856 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 FBXO21O94952 628 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 CCR10P46092 362 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 INSCQ1MX18 579 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 SNX32Q86XE0 403 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 CCNYQ8ND76 341 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 DTNBP1Q96EV8 351 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 GRIP2Q9C0E4 1043 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 PDGFCQ9NRA1 345 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 PSMD13Q9UNM6 376 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa27.68■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 USP12O75317 370 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 CLPTM1O96005 669 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 ADORA2BP29275 332 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 THOP1P52888 689 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 PKNOX1P55347 436 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 FSCBQ5H9T9 825 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 ATXN10Q9UBB4 475 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 LZTS1Q9Y250 596 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 USP3Q9Y6I4 520 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 SETSIPP0DME0 302 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 TXNP10599 105 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 ARL4AP40617 200 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 PGGT1BP53609 377 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 DLK2Q6UY11 383 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 RTKNQ9BST9 563 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 AK5Q9Y6K8 562 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 CFLARO15519 480 aa27.66■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 PEX1O43933 1283 aa27.66■■■□□ 2.02
FAM149A-201ENST00000227065 LTFP02788 710 aa27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms