RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 EPB41L1Q9H4G0 881 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPRFP10586 1907 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 CNMDO75829 334 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 GMPRP36959 345 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS6KA3P51812 740 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 LIMK2P53671 638 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 CLEC14AQ86T13 490 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PGBD4Q96DM1 585 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 FERMT1Q9BQL6 677 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 DERAQ9Y315 318 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PPEF2O14830 753 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 HSPA4LO95757 839 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 CHN2P52757 468 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 NAPRTQ6XQN6 538 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 HIPK4Q8NE63 616 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 AKT3Q9Y243 479 aa22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ZMPSTE24O75844 475 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 MPOP05164 745 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 BCAT1P54687 386 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 LSAMPQ13449 338 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PDK1Q15118 436 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF567Q8N184 647 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 STK39Q9UEW8 545 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 FZD9O00144 591 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 LCP1P13796 627 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 CES3Q6UWW8 571 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 TNS4Q8IZW8 715 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ICA1LQ8NDH6 482 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 MAPK15Q8TD08 544 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 NDUFA13Q9P0J0 144 aa22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 EVPLQ92817 2033 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 E9PBE3 544 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 DENRO43583 198 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL41O60662 606 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC25A27O95847 323 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 VTNP04004 478 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ACADSBP45954 432 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 FOLH1Q04609 750 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SNAPC2Q13487 334 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 NAT14Q8WUY8 206 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 CNDP1Q96KN2 507 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1-201ENST00000218364 KPNA7A9QM74 516 aa22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 MATKP42679 507 aa22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ALDH1A3P47895 512 aa22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 VGLL4Q14135 290 aa22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM131BQ86XD5 332 aa22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 PQLC1Q8N2U9 271 aa22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 MARVELD2Q8N4S9 558 aa22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 CEP41Q9BYV8 373 aa22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 DTNAQ9Y4J8 743 aa22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 THRAP10827 490 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM135Q86UB9 458 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 C7orf31Q8N865 590 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM13O60858 407 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXO21O94952 628 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB6Q15916 424 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 STRA8Q7Z7C7 330 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF139Q8WU17 664 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 HSFY1Q96LI6 401 aa22.63■■□□□ 1.21
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