RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Neu1O35657 409 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AvilO88398 819 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prl3b1P09586 222 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dpy19l2P0CW70 773 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PcnaP17918 261 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wnt3aP27467 352 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TktP40142 623 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdh5P55284 784 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnq1P97414 668 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oog3Q3UWY1 500 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tcaf3Q6QR59 914 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pqlc1Q80XM9 271 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb41Q811F1 908 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxo44Q8BK26 255 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tlk1Q8C0V0 766 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Galnt5Q8C102 930 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Robo4Q8C310 1012 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3411Q8C7R2 150 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mark4Q8CIP4 752 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Agap3Q8VHH5 910 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Creld1Q91XD7 420 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lysmd3Q99LE3 305 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atg7Q9D906 698 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1160A2AVT0 319 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slfn9B1ARD6 910 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700024B05RikE9Q6D7 167 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hmgxb3G3X9M3 1254 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 OmdO35103 423 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Exoc7O35250 697 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klc2O88448 599 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 InvsO89019 1062 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hoxc10P31257 342 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdo1P60334 200 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbp2P70695 339 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ak8Q32M07 479 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 E330034G19RikQ3UWX6 351 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scube3Q66PY1 993 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl14Q69ZK5 630 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scaf8Q6DID3 1268 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Paqr6Q6TCG5 343 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akap7Q7TN79 314 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb5Q7TQG0 670 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr23Q7TRX4 325 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr293Q7TS10 336 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cept1Q8BGS7 416 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CcnyQ8BGU5 341 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ipo11Q8K2V6 975 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CarfQ8VHI4 689 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stk33Q924X7 491 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tas1r1Q99PG6 842 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pgm3Q9CYR6 542 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akr1c12Q9JLI0 323 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ggps1Q9WTN0 300 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brca1P48754 1812 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcng1A2BDX4 514 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ces1bD3Z5G7 567 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gimd1E9PW74 217 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm7694J3QNH8 270 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10721J3QPJ9 223 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chrna1P04756 457 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pim1P06803 397 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gnao1P18872 354 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt6aP50446 553 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp46P62069 366 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IhhP97812 411 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Coq10bQ3THF9 240 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myo1gQ5SUA5 1024 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ScinQ60604 715 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mysm1Q69Z66 819 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc39a14Q75N73 489 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc16a9Q7TM99 508 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fastkd5Q7TMV3 762 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem198Q8BG75 360 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspbap1Q8BK58 483 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Afap1l1Q8BZI0 768 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prpf39Q8K2Z2 665 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NeproQ8R2U2 564 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ssx2ipQ8VC66 615 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GcshQ91WK5 170 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gstt4Q9D4P7 240 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam227bQ9D518 532 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppil2Q9D787 521 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kdelc1Q9JHP7 502 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Limd1Q9QXD8 668 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpc1Q9QZF2 557 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plod3Q9R0E1 741 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spin2dB1B0R2 236 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Erich2E9Q1A6 463 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt10P02535 570 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ap1g1P22892 822 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arf4P61750 180 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mpp1P70290 466 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SiaeP70665 541 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RnaselQ05921 735 aa6.75□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt26Q3TRJ4 462 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.1 ms