RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004201.7

Col5a3-201, Transcript of Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col5a3, Length 6,119 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vwa1Q8R2Z5 415 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Q9D4A5 307 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Abcb9Q9JJ59 762 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Trmt1lA2RSY6 728 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zfp358E9Q8M1 571 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pcdh9F8VPK8 1237 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 ErfP70459 551 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Upf3aQ3ULJ3 422 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem169Q8BG50 297 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mboat7Q8CHK3 473 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Acvr1cQ8K348 493 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 IlkapQ8R0F6 392 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Q922M7 232 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem59Q9QY73 323 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm11983V9GXS8 105 aa14.75□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm3526E9PZM0 191 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Aldh3a2P47740 484 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 NrlP54846 237 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dph1Q5NCQ5 438 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Brat1Q8C3R1 822 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Il31raQ8K5B1 716 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 MyocdQ8VIM5 935 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vangl2Q91ZD4 521 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tdrd1Q99MV1 1172 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rprd1bQ9CSU0 326 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 4930579F01RikE9Q3L6 325 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 DcakdQ8BHC4 231 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Spon1Q8VCC9 807 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Eif3mQ99JX4 374 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 NwcQ9CQI4 244 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Osbpl3Q9DBS9 855 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tssc4Q9JHE7 317 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mettl1Q9Z120 268 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Lipo2D3YY49 398 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Arhgap28Q8BN58 729 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Hkdc1Q91W97 915 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PpidQ9CR16 370 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cyp2c55Q9D816 490 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sars2Q9JJL8 518 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tecpr2Q3UH45 1423 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mtnd4P03911 459 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rnf180Q3U827 592 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Camk1dQ8BW96 385 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Robo4Q8C310 1012 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Usp20Q8C6M1 916 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 DaglbQ91WC9 669 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rab11fip1Q9D620 645 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Klhl4B1AZR0 717 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stk16O88697 305 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 IapP03975 557 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Brsk2Q69Z98 735 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mief1Q8BGV8 463 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Trim14Q8BVW3 440 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 CrebzfQ91ZR3 358 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 4930503E14RikQ9D583 177 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ngly1Q9JI78 651 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sh3glb1Q9JK48 365 aa14.74□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm5930D3Z257 264 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 XntrpcF8VQM8 1264 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Hmgb3O54879 200 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 HunkO88866 714 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Il1aP01582 270 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 EpoP07321 192 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Elk3P41971 409 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fosl2P47930 326 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Abcg2Q7TMS5 657 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Asnsd1Q8BFS9 627 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pkn3Q8K045 878 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 HpgdQ8VCC1 269 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Exosc4Q921I9 245 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vta1Q9CR26 309 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cep72Q9D3R3 646 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gdap2Q9DBL2 498 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Trpc2Q9R244 1172 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Celf2Q9Z0H4 508 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Atp6v1c1Q9Z1G3 382 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 CcniQ9Z2V9 377 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pdk4O70571 412 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vps26aP40336 327 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Erbb2P70424 1256 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zscan26Q5RJ54 466 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cand2Q6ZQ73 1235 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 SowahdQ8BY98 327 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Necab2Q91ZP9 389 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccnb1ip1D3Z3K2 276 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 H2-Eb1P04230 264 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PcnaP17918 261 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Bace1P56818 501 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Plk1Q07832 603 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem109Q3UBX0 243 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Magee2Q52KG3 523 aa14.73□□□□□ -0.05
Col5a3-201ENSMUST00000004201 HpseQ6YGZ1 535 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.1 ms