RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC25A27	O95847	323 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	T-ENOL	P0DO92	83 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC142	Q17RM4	750 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNMB4	Q86W47	210 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	SPATA13	Q96N96	652 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	VPS33B	Q9H267	617 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	LHX5	Q9H2C1	402 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	MFSD11	O43934	449 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	WSCD1	Q658N2	575 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	OPTN	Q96CV9	577 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	HIC2	Q96JB3	615 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	PCYT2	Q99447	389 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	AGAP2	Q99490	1192 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ERCC2	P18074	760 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	LBX2	Q6XYB7	198 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	CERS2	Q96G23	380 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	PIDD1	Q9HB75	910 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	CAPN8	A6NHC0	703 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	GFAP	P14136	432 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	GCA	P28676	217 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ADORA2A	P29274	412 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	GRIK1	P39086	918 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF398	Q8TD17	642 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	TEPSIN	Q96N21	525 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	SNX15	Q9NRS6	342 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	GRK2	P25098	689 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	AGK	Q53H12	422 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	FICD	Q9BVA6	458 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	PDP2	Q9P2J9	529 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	AMH	P03971	560 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ACADSB	P45954	432 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	SERPINB8	P50452	374 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ACAP1	Q15027	740 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	TTC30A	Q86WT1	665 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	PSAT1	Q9Y617	370 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	MPST	P25325	297 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	GSTT1	P30711	240 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	TCEAL1	Q15170	157 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ILDR2	Q71H61	639 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ASRGL1	Q7L266	308 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	TMC7	Q7Z402	723 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-223	ENST00000639525	ERO1B	Q86YB8	467 aa		12.03	□□□□□ -0.48

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