RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631043.2

TCF4-275, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 510 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-275	ENST00000631043	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	OPTN	Q96CV9	577 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	PCYT2	Q99447	389 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CARD9	Q9H257	536 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	AZI2	Q9H6S1	392 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	AKT3	Q9Y243	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	ANK1	P16157	1881 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	COL1A2	P08123	1366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	RAD51C	O43502	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	ADCY3	O60266	1144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	FKTN	O75072	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	RTN2	O75298	545 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CD4	P01730	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CYP1A2	P05177	515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	EDN1	P05305	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CLTA	P09496	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	MYBL1	P10243	752 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	MYBL2	P10244	700 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CYP11B1	P15538	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	HSPA6	P17066	643 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	PRKCA	P17252	672 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	DES	P17661	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	ABCB4	P21439	1286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	PAX7	P23759	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CXCR5	P32302	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	GRK6	P43250	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	SLC26A2	P50443	739 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	STAT5B	P51692	787 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	EFNA5	P52803	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	AP3M2	P53677	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	SLURP1	P55000	103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	GABRE	P78334	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	TSPY1	Q01534	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CDR2	Q01850	454 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	FSTL1	Q12841	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	GALE	Q14376	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	MREG	Q8N565	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-275	ENST00000631043	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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