RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624927.3

LINC01128-215, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1128, human

TSL 5

Gene LINC01128, Length 677 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01128-215	ENST00000624927	PRF1	P14222	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	IL1R1	P14778	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	PEX2	P28328	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	HSF1	Q00613	529 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	NRAC	Q8N912	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	FYB1	O15117	783 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	TSPAN6	O43657	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	MT-ND5	P03915	603 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	RBL1	P28749	1068 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	TACR3	P29371	465 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	GBX1	Q14549	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	SEC23B	Q15437	767 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	COL15A1	P39059	1388 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	ACE	P12821	1306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	CTSA	P10619	480 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	SCP2	P22307	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	NTSR1	P30989	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	EPHX2	P34913	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	GPC5	P78333	572 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	CFHR1	Q03591	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	GRM3	Q14832	879 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927		Q7L0L9	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	SNX22	Q96L94	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	CACNA1G	O43497	2377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	USP12	O75317	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	CD63	P08962	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	CHRNA5	P30532	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	THBS4	P35443	961 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	JAK3	P52333	1124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	COPA	P53621	1224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	STIM1	Q13586	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01128-215	ENST00000624927	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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