RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 PTPRNQ16849 979 aa22.88■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.88■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 NADSYN1Q6IA69 706 aa22.88■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 RFWD3Q6PCD5 774 aa22.88■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 DBX2Q6ZNG2 339 aa22.88■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 CHST9Q7L1S5 443 aa22.88■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 SLC39A13Q96H72 371 aa22.88■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 FAM81BQ96LP2 452 aa22.88■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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SRRT-218ENST00000620394 ACADMP11310 421 aa22.87■■□□□ 1.25
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SRRT-218ENST00000620394 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.86■■□□□ 1.25
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SRRT-218ENST00000620394 FBRSQ9HAH7 460 aa22.86■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 ST7Q9NRC1 585 aa22.86■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.86■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.86■■□□□ 1.25
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SRRT-218ENST00000620394 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.85■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 BECN2A8MW95 431 aa22.85■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 TBL1XO60907 577 aa22.85■■□□□ 1.25
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SRRT-218ENST00000620394 MFN1Q8IWA4 741 aa22.84■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 FIBINQ8TAL6 211 aa22.84■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 SNX19Q92543 992 aa22.84■■□□□ 1.25
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SRRT-218ENST00000620394 THAP12O43422 761 aa22.83■■□□□ 1.25
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SRRT-218ENST00000620394 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.83■■□□□ 1.25
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SRRT-218ENST00000620394 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SRRT-218ENST00000620394 ZBTB16Q05516 673 aa22.82■■□□□ 1.24
SRRT-218ENST00000620394 CAMK2BQ13554 666 aa22.82■■□□□ 1.24
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